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Enregistrement W1482354857 · doi:10.1002/9780470015902.a0020107

Modelling of Plant Growth and Development

2009· other· en· W1482354857 sur OpenAlexaff
Anne‐Gaëlle Rolland‐Lagan

Notice bibliographique

RevueEncyclopedia of Life Sciences · 2009
Typeother
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMorphogenAuxinPhyllotaxisBiological systemBiologyPlant growthPlant developmentPlant hormoneBiophysicsComputational biologyShootBotanyGeneGeneticsMeristem

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The development of an organism results from complex interactions between biophysical and biochemical processes and is very dynamic. Therefore the mechanisms at play are best studied using computer simulations. The large amount of molecular data on multiple aspects of plant development and advances in plant imaging make it possible to use simulation modelling as a tool to complement experimental studies. For instance, models of gene regulation networks can predict genetic interactions, which can later be tested experimentally. Models of pattern formation in the root and the shoot based on the transport of the plant hormone auxin can simulate the localization of proteins involved in auxin efflux as well as generating realistic profiles of auxin distribution. Models are also starting to incorporate growth and the role of mechanical forces in development, which should provide a link between molecular biology studies and biophysics. Key concepts Plant development is highly dynamic as pattern formation and growth occur concurrently. Modelling studies which can account for observed experimental data suggest genetic interactions in space can generate spatial patterns during plant development in a similar way to reaction‐diffusion mechanisms initially postulated in the middle of the twentieth century. Models of the relation between auxin gradient and root growth suggests the plant hormone auxin acts similarly to a morphogen. In the case of auxin the response to the morphogen may affect the morphogen gradient. This feedback mechanism can generate patterns similar to reaction diffusion and may account for phyllotaxis and leaf vein pattern formation. Experimental data is still needed to link models of auxin‐regulated pattern formation with gene regulatory networks. Mechanical forces affect growth and pattern formation. Methodologies are being developed to model the biomechanics of growth and integrate patterning through chemical and physical processes at various scales of organization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,595
Score d'incertitude au seuil0,219

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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