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Enregistrement W1483763119 · doi:10.4049/jimmunol.192.supp.53.10

The autoimmunity-associated gene CLEC16A controls HLA-II expression by participating in the molecular machinery of late endosomal maturation (HUM2P.337)

2014· article· en· W1483763119 sur OpenAlexaff
Jon D. Laman, Marvin van Luijn, Karim L. Kreft, Marlieke L.M. Jongsma, Steven W. Mes, Annet F. Wierenga‐Wolf, Marjan van Meurs, Marie‐José Melief, Rik van der Kant, Lennert Janssen, Hans Janssen, John J. Priatel, Rusung Tan, Jacques Neefjes, Rogier Hintzen

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueGalectins and Cancer Biology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndosomeBiologyCell biologySmall hairpin RNAGene knockdownEffectorCIITARNA interferenceImmunologyGeneImmune systemT cellGeneticsRNAMHC class II

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In GWA studies, CLEC16A has been identified as a risk gene for several major autoimmune diseases, including multiple sclerosis (MS). We show that CLEC16A is increased in MS and functionally links to HLA-II, and uncovered the molecular mechanism of CLEC16A as key regulator of HLA-II antigen presentation. We used the human melanoma cell line MelJuSo and primary moDC as APC models to silence CLEC16A with different siRNA and lentiviral shRNA. CLEC16A knockdown in MelJuSo cells and moDC resulted in cytoplasmic dispersion and strong accumulation of HLA-II+ late endosomes, suggesting impaired formation of multivesicular late endosomal compartments, i.e. MIIC. Indeed, in CLEC16A shRNA transductants, MIIC contained no or a few abnormally enlarged internal vesicles and showed an increased number of HLA-II molecules as compared to scrambled shRNA transductants of MelJuSo cells. CLEC16A associated with Rab7-interacting lysosomal protein (RILP) and the homotypic fusion and protein sorting (HOPS) complex, two members of the dynein motor complex regulating late endosomal trafficking and maturation. In addition, CLEC16A silencing disrupted RILP-mediated recruitment of HLA-II+ late endosomes to perinuclear regions. We reveal direct involvement of CLEC16A in the machinery regulating late endosomal processing of HLA-II. This novel C-type lectin function supports a pathogenic role of CLEC16A in autoimmune disease by promoting HLA-II antigen presentation via the formation of MIIC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,114
Score d'incertitude au seuil0,457

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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