The autoimmunity-associated gene CLEC16A controls HLA-II expression by participating in the molecular machinery of late endosomal maturation (HUM2P.337)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract In GWA studies, CLEC16A has been identified as a risk gene for several major autoimmune diseases, including multiple sclerosis (MS). We show that CLEC16A is increased in MS and functionally links to HLA-II, and uncovered the molecular mechanism of CLEC16A as key regulator of HLA-II antigen presentation. We used the human melanoma cell line MelJuSo and primary moDC as APC models to silence CLEC16A with different siRNA and lentiviral shRNA. CLEC16A knockdown in MelJuSo cells and moDC resulted in cytoplasmic dispersion and strong accumulation of HLA-II+ late endosomes, suggesting impaired formation of multivesicular late endosomal compartments, i.e. MIIC. Indeed, in CLEC16A shRNA transductants, MIIC contained no or a few abnormally enlarged internal vesicles and showed an increased number of HLA-II molecules as compared to scrambled shRNA transductants of MelJuSo cells. CLEC16A associated with Rab7-interacting lysosomal protein (RILP) and the homotypic fusion and protein sorting (HOPS) complex, two members of the dynein motor complex regulating late endosomal trafficking and maturation. In addition, CLEC16A silencing disrupted RILP-mediated recruitment of HLA-II+ late endosomes to perinuclear regions. We reveal direct involvement of CLEC16A in the machinery regulating late endosomal processing of HLA-II. This novel C-type lectin function supports a pathogenic role of CLEC16A in autoimmune disease by promoting HLA-II antigen presentation via the formation of MIIC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».