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Enregistrement W1484003115 · doi:10.1111/j.1600-6143.2005.01119.x

Metabolomics: The Principles and Potential Applications to Transplantation

2005· review· en· W1484003115 sur OpenAlexafffund
David S. Wishart

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Transplantation · 2005
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesGenome Prairie
Mots-clésMetabolomicsMetabolite profilingMetaboliteMedicineOrgan transplantationTransplantationComputational biologyMetabolomeProteomicsBioinformaticsPhysiologyBiologyInternal medicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This review provides a summary of the applications and potential applications of metabolite profiling (i.e. metabolomics) in monitoring organ transplants. While the concept of metabolomics is relatively new to organ transplantation, the idea of measuring metabolites as a quick, noninvasive probe of organ function is not. Indeed, metabolite measurements of serum creatinine have long been used to assess pre‐ and post‐operative organ function. Over the past 10 years, a number of lesser‐known, organ‐specific metabolites have also been shown to be good diagnostic indicators of both organ function and viability. In general, metabolomics offers a complementary picture to what can be revealed via techniques based on genomics, proteomics or histology. Because metabolic changes typically happen within seconds or minutes after an ‘event’, whereas some transcript, protein abundance or tissue changes may take place over days or weeks, metabolomic measurements may offer a particularly useful and inexpensive diagnostic tool to monitor donor organ viability or to detect organ rejection. The excitement associated with metabolomics, however, must be tempered by the fact that the technology for rapid metabolite identification is still in its infancy, and that metabolites are but one part of a very complex picture pertaining to organ function. This review provides a summary of the applications and potential applications of metabolite profiling (i.e. metabolomics) in monitoring organ transplants. While the concept of metabolomics is relatively new to organ transplantation, the idea of measuring metabolites as a quick, noninvasive probe of organ function is not. Indeed, metabolite measurements of serum creatinine have long been used to assess pre‐ and post‐operative organ function. Over the past 10 years, a number of lesser‐known, organ‐specific metabolites have also been shown to be good diagnostic indicators of both organ function and viability. In general, metabolomics offers a complementary picture to what can be revealed via techniques based on genomics, proteomics or histology. Because metabolic changes typically happen within seconds or minutes after an ‘event’, whereas some transcript, protein abundance or tissue changes may take place over days or weeks, metabolomic measurements may offer a particularly useful and inexpensive diagnostic tool to monitor donor organ viability or to detect organ rejection. The excitement associated with metabolomics, however, must be tempered by the fact that the technology for rapid metabolite identification is still in its infancy, and that metabolites are but one part of a very complex picture pertaining to organ function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,998
Score d'incertitude au seuil0,624

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations188
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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