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Enregistrement W1484078634 · doi:10.1159/000125935

Metabolomics: A Complementary Tool in Renal Transplantation

2008· review· en· W1484078634 sur OpenAlexafffund
David S. Wishart

Notice bibliographique

RevueContributions to nephrology · 2008
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensNational Institute for Nanotechnology
Organismes subventionnairesGenome AlbertaGenome Canada
Mots-clésMetabolomicsKidneyKidney transplantationTransplantationMedicineUrineOmicsCreatinineBioinformaticsBiologyComputational biologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Renal transplant success is closely tied to the ability to monitor transplant recipients and responsively change their medications. However, transplant monitoring still depends on relatively dated technologies - serum creatinine levels, urine output, and histopathology of biopsy samples. These techniques do not offer sufficient specificity, sensitivity, or accuracy for appropriate and timely interventions. As a result, more specific diagnostic techniques, based on proteomics, genomics and metabolomics are being sought. Metabolomics (the high-throughput measurement and analysis of metabolites) may make it possible to monitor transplants more effectively and specifically. Changes in the concentration profiles of a number of small molecule metabolites found in either blood or urine can be used to localize kidney damage, assess organs at risk of rejection, assess kidneys suffering from ischemiareperfusion injury or identify organs that have been damaged by immunosuppressive drugs. The application of metabolomics to kidney transplant monitoring is still in its early stages. Nevertheless, there are a number of easily measured metabolites in both urine and serum that can provide reliable indications of kidney function, kidney injury, and immunosuppressive drug toxicity. Metabolomics could serve as a good complement to existing proteomic and genomic technologies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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