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Enregistrement W1486174444 · doi:10.1111/j.1750-3639.2010.00416.x

Analysis of TSC Cortical Tubers by Deep Sequencing of TSC1, TSC2 and KRAS Demonstrates that Small Second‐Hit Mutations in these Genes are Rare Events

2010· article· en· W1486174444 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBrain Pathology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberous Sclerosis Complex Research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institutes of Health
Mots-clésTSC1Tuberous sclerosisTSC2KRASBiologyMutationExonPoint mutationCoding regionGeneCancer researchGeneticsPathologyMedicinePI3K/AKT/mTOR pathwaySignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tuberous sclerosis complex (TSC) is an often severe neurocutaneous syndrome. Cortical tubers are the predominant neuropathological finding in TSC, and their number and location has been shown to correlate roughly with the severity of neurologic features in TSC. Past studies have shown that genomic deletion events in TSC1 or TSC2 are very rare in tubers, and suggested the potential involvement of the MAPK pathway in their pathogenesis. We used deep sequencing to assess all coding exons of TSC1 and TSC2, and the activating mutation hot spots within KRAS in 46 tubers from TSC patients. Germline heterozygous mutations were identified in 81% of tubers. The same secondary mutation in TSC2 was identified in six tuber samples from one individual. Further study showed that this second hit mutation was widely distributed in the cortex from one cerebral hemisphere of this individual at frequencies up to 10%. No other secondary mutations were found in the other 40 tubers analyzed. These data indicate that small second hit mutations in any of these three genes are very rare in TSC tubers. However, in one TSC individual, a second hit TSC2 point mutation occurred early during brain development, and likely contributed to tuber formation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,406
Score d'incertitude au seuil0,595

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle