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Enregistrement W1486346849 · doi:10.1038/35001059

Ancestral chloroplast genome in Mesostigma viride reveals an early branch of green plant evolution

2000· article· en· W1486346849 sur OpenAlexafffund
Claude Lemieux, Christian Otis, Monique Turmel

Notice bibliographique

RevueNature · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesFourth Framework ProgrammeNatural Environment Research CouncilEuropean CommissionNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institute for Advanced Research
Mots-clésBiologyChlorophytaLineage (genetic)Green algaeChloroplastChloroplast DNAPhylumGenomeEvolutionary biologyBotanyFlagellateAlgaeGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sequence comparisons suggest that all living green plants belong to one of two major phyla: Streptophyta (land plants and their closest green algal relatives, the charophytes); and Chlorophyta (the rest of green algae). Because no green algae are known that pre-date the Streptophyta/Chlorophyta split, and also because the earliest diverging green algae show considerable morphological variation, the nature of the unicellular flagellate ancestor of the two green plant phyla is unknown. Here we report that the flagellate Mesostigma viride belongs to the earliest diverging green plant lineage discovered to date. We have sequenced the entire chloroplast DNA (118,360 base pairs) of this green alga and have conducted phylogenetic analyses of sequences derived from this genome. Mesostigma represents a lineage that emerged before the divergence of the Streptophyta and Chlorophyta, a position that is supported by several features of its chloroplast DNA. The structure and gene organization of this genome indicate that chloroplast DNA architecture has been extremely well conserved in the line leading to land plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,899
Score d'incertitude au seuil0,454

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations288
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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