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Enregistrement W1487117896 · doi:10.17305/bjbms.2015.348

NOD2/CARD15 mutations in Polish and Bosnian populations with and without Crohn's disease: prevalence and genotype-phenotype analysis

2015· article· en· W1487117896 sur OpenAlexaboutno aff
Nermin N. Salkić, Grażyna Adler, Iwona Zawada, Ervin Alibegović, Beata Karakiewicz, Anna Kozlowska‐Wiechowska, Michał Wasilewicz, Violetta Sulżyc‐Bielicka, Dariusz Bielicki

Notice bibliographique

RevueBiomolecules and Biomedicine · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNOD2GenotypeCrohn's diseaseGastroenterologyMedicineInternal medicineAlleleMutationSingle-nucleotide polymorphismDiseaseBosnianPopulationBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Data on prevalence and phenotypic consequences of nucleotide-binding oligomerisation domain 2/caspase recruitment domains 15 (NOD2/CARD15) variants in Crohn's disease (CD) population in Poland and Bosnia and Herzegovina (B&H) are nonexistent. We aimed to determine the prevalence of NOD2/CARD15 mutations and their association with disease phenotype in Polish and Bosnian patients with CD and in healthy controls. We prospectively recruited 86 CD patients and 83 controls in Poland and 30 CD patients and 30 controls in B&H, 229 in total. We determined the prevalence of NOD2/CARD15 mutations and their association with the disease phenotype according to Montreal classification. Participants were genotyped for Leu1007fsinsC and Gly908Arg mutations. At least one CD-associated allele was found in 29/86 (33.7%) of Polish CD patients and in 9/83 (10.8%) of healthy controls (p<0.001). In both CD patients and controls in Bosnian sample, at least one NOD2 mutation was found in equal number of patients (3/30; 10%) with all of the NOD2 mutation positive CD patients being homozygous, while controls being heterozygous. In Polish sample, perianal disease was less frequent in CD patients with any NOD2 mutation (1/21; 4.8%) compared to those without (11/41; 26.8%; p=0.046). Higher percentage of patients with NOD2 mutations had history of CD related surgery when compared with those without mutations (66.7% vs. 43.3%; p=0.05). The risk for CD is increased in patients with NOD2 mutations (Poland) and especially in the presence of homozygous NOD2 mutations (Poland and Bosnia). The presence of variant NOD2 alleles is associated with increased need for surgery and reduced occurrence of perianal disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,539

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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