Contribution of VH Replacement Products to the Generation of Autoreactive Antibodies in Systemic Lupus Erythematosus (129.4)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Systemic lupus erythematosus (SLE) is characterized by the production of high affinity autoantibodies against various nuclear antigens. To gain insight into the mechanisms of autoantibody generation during the course of SLE, we performed single cell PCR analysis and obtained about 200 IgH genes with paired Igκ or Igλ genes from the plasma cells (CD19lowCD27high) and naïve B cells (CD19+CD27−) of three SLE patients. The SLE derived IgH genes have longer CDR3 regions with enriched Arg residues, which are the common features of autoantibodies. SLE plasma cells derived IgH and IgL genes are highly mutated, indicating their positive selection and active involvement in the abnormal immune responses. Interestingly, analyses of the IgL and IgH genes derived from SLE patients showed signs of excessive secondary recombination when compared with those from healthy donors, such as elevated usages of downstream Jκ4, Jκ5, and Jλ3 genes in the IgL genes and concurrently, significantly elevated frequencies of VH replacement products in the IgH genes derived from SLE patients. All the VH replacement “footprints” preferentially contribute charged amino acids into the IgH CDR3 regions. Initial testing of 12 recombinant antibodies derived from SLE plasma cells showed seven of them recognize peri-nuclear antigens. Importantly, the identified VH replacement products directly encode autoantibodies. These findings revealed for the first time that excessive secondary recombination occurred on both IgL and IgH genes in SLE patients and the enriched VH replacement products in SLE plasma cells directly encode autoantibodies.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».