A subgroup of pancreatic adenocarcinoma is sensitive to the 5-aza-dC DNA methyltransferase inhibitor
Notice bibliographique
Résumé
// Odile Gayet 1 , Celine Loncle 1 , Pauline Duconseil 1 , Marine Gilabert 1 , Maria Belen Lopez 1 , Vincent Moutardier 1, 2 , Olivier Turrini 1, 3 , Ezequiel Calvo 4 , Jacques Ewald 3 , Marc Giovannini 3 , Mohamed Gasmi 5 , Erwan Bories 3 , Marc Barthet 5 , Mehdi Ouaissi 6 , Anthony Goncalves 3 , Flora Poizat 3 , Jean Luc Raoul 3 , Veronique Secq 1, 2 , Stephane Garcia 1, 2 , Patrice Viens 3 , Nelson Dusetti 1 , Juan Iovanna 1 1 Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), INSERM U1068, CNRS UMR 7258, Aix-Marseille Université and Institut Paoli-Calmettes, Parc Scientifique et Technologique de Luminy, Marseille, France 2 Hôpital Nord, Marseille, France 3 Institut Paoli-Calmettes, Marseille, France 4 Centre Génomique du Centre de recherche du CHUL Research Center, Quebec, Canada 5 Hôpital Nord, Département de Gastroentérologie, Marseille, France 6 Hôpital de la Timone, Marseille, France Correspondence to: Nelson Dusetti, e-mail: nelson.dusetti@inserm.fr Juan Iovanna, e-mail: juan.iovanna@inserm.fr Received: August 05, 2014 Accepted: November 02, 2014 Published: December 03, 2014 ABSTRACT Pancreatic Ductal Adenocarcinoma (PDAC) is a disease with a great heterogeneity in the response to treatments. To improve the responsiveness to treatments there are two different approaches, the first one consist to develop new and more efficient drugs that intent to cure all patients and the second one is to use already-approved drugs, alone or in combination, but selecting beforehand the most sensitive patients. In this work we explored the efficiency of the second possibility. We developed a collection of 17 PDAC samples collected by Endoscopic Ultrasound-Guided Fine-Needle Aspiration (EUS-FNA) or surgery and preserved as xenografts and as primary cultures. This collection was characterized at molecular level by a transcriptomic analysis using an Affymetrix approach. In this paper we present data demonstrating that a subgroup of PDAC responds to low doses of 5-aza-dC. These tumors show a specific RNA expression profile that could serve as a marker, but there is no correlation with Dnmt1 , Dnmt3A or Dnmt3B expression. Responder tumors corresponded to well-differentiated samples and longer survival patients. In conclusion, we present data obtained with the well-known drug 5-aza-dC as a proof of concept that a drug that seems to be inefficient in solid tumors in general could be applicable to a particular subgroup of patients with PDAC.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».