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Enregistrement W1488370331 · doi:10.1111/j.1365-2672.2007.03488.x

Regulation of alkaline metalloprotease promoter by N-acyl homoserine lactone quorum sensing in Pseudomonas fluorescens

2007· article· en· W1488370331 sur OpenAlexafffund
Mei Liu, H. Wang, Mansel W. Griffiths

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesDairy Farmers of OntarioUniversity of Guelph
Mots-clésPseudomonas fluorescensQuorum sensingHomoserineBiochemistryMicrobiologyBiologyBacteriaChemistryGeneVirulenceGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: To examine the involvement of N-acyl homoserine lactone (AHL) quorum sensing in alkaline metalloprotease (aprX) promoter regulation in a Pseudomonas fluorescens milk isolate. METHODS AND RESULTS: N-acyl homoserine lactone signals from P. fluorescens strain 395 were separated and detected by thin layer chromatography (TLC). Further analysis of the AHL signals using liquid chromatography-electrospray ionization-mass spectrometry (LC-ESI-MS) indicated the presence of C4-HSL and 3OC8-HSL. The expression of aprX in P. fluorescens 395 was investigated, using a transcriptional fusion between the aprX promoter and a mutated gfp variant gene (gfp[mut3]). The results demonstrated that the activity of the aprX promoter increased dramatically in the late exponential phase of growth, indicating growth phase-dependent regulation. The activity was repressed in an AHL-deficient environment, in which the signal molecules were hydrolysed by the enzyme AHL lactonase. CONCLUSIONS: N-acyl homoserine lactones produced by P. fluorescens 395 were identified to be C4-HSL and 3OC8-HSL. The protease gene in P. fluorescens is regulated by the AHL-based quorum sensing system at a transcriptional level during the late exponential growth phase. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: This study contributes to our understanding of the genetic regulation and ecology of P. fluorescens in the economically important system of food spoilage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,655

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations85
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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