Almost but not quite a subspecies: a case of genetic but not morphological diagnosability in Nicrophorus (Coleoptera: Silphidae)
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Allopatric populations that show genetic differentiation but lack phenotypic diagnosability are difficult to classify. In 1946, Arnett described a new species of burying beetle (Silphidae: Nicrophorus) from Luzon Island, Philippines, Nicrophorus benguetensis. In 2002, Sikes et al., finding the species to be inconsistently diagnosable, synonymized N. benguetensis under Nicrophorus nepalensis Hope 1831. We rigorously and quantitatively test the validity of N. benguetensis using several different species delimitation criteria. We employed discrete and quantitative character-based methods to test similarity criteria using linear morphometrics in a discriminant analysis framework, and percentage sequence divergences based on sequences from four mitochondrial DNA (mtDNA) genes (COI, COII, ND4 and ND5) and two nuclear genes [28S (D2 region) and CAD]. We also employed tree-based methods to test phylogenetic criteria using mtDNA sequences and morphology with parsimony, Bayesian inference and maximum likelihood. The analysis of discrete phenotypic characters did not reliably diagnose N. benguetensis. The results of the discriminant analysis provided moderate support for the validity of N. benguetensis (71.4% of the specimens were properly classified). There is adequate genetic distance between N. benguetensis and its nearest neighbour for DNA barcoding to identify an unknown sequence, although this may be an artefact of the small sample size. Phylogenetic analyses of the morphological data, with and without the morphometric data, yielded unresolved trees. Molecular phylogenetic results found N. benguetensis to be monophyletic, but neither clearly rejected nor supported its validity. Two of our approaches using molecular data diagnosed N. benguetensis, but those that used phenotypic data did not exceed a 75% success rate. We conclude, therefore, that N. benguetensis, despite being a weakly distinct allopatric population, and deserving of additional study, should remain synonymized until further analysis suggests otherwise.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle