Functional analysis of polar amino‐acid residues in membrane associated regions of the NHE1 isoform of the mammalian Na<sup>+</sup>/H<sup>+</sup> exchanger
Notice bibliographique
Résumé
The NHE1 isoform of the Na+/H+ exchanger is a ubiquitous plasma membrane protein that regulates intracellular pH in mammalian cells. Site-specific mutagenesis was used to examine the functional role of conserved, polar amino-acid residues occurring in segments of the protein associated with the membrane. Seventeen mutant proteins were assessed by characterization of intracellular pH changes in stably transfected cells that lacked an endogenous Na+/H+ exchanger. All of the mutant proteins were targeted correctly to the plasma membrane and were expressed at similar levels. Amino-acid residues Glu262 and Asp267 were critical to Na+/H+ exchanger activity while mutation of Glu391 resulted in only a partial reduction in activity. The Glu262-->Gln mutant was expressed partially as a deglycosylated protein with increased sensitivity to trypsin treatment in presence of Na+. Substitution of mutated Glu262, Asp267 and Glu391 with alternative acidic residues restored Na+/H+ exchanger activity. The Glu262-->Asp mutant had a decreased affinity for Li+, but its activity for Na+ and H+ ions was unaffected. The results support the hypothesis that side-chain oxygen atoms in a few, critically placed amino acids are important in Na+/H+ exchanger activity and the acidic amino-acid residues at positions 262, 267 and 391 are good candidates for being involved in Na+ coordination by the protein.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».