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Enregistrement W1489477345 · doi:10.1111/j.1863-2378.2012.01474.x

Molecular Epidemiology of<i>Cryptosporidium</i>and<i>Giardia</i>in Humans on Prince Edward Island, Canada: Evidence of Zoonotic Transmission From Cattle

2012· article· en· W1489477345 sur OpenAlexafffundabout
Ebo Budu-Amoako, Spencer J. Greenwood, Brent R. Dixon, Linda Sweet, Li Wei Ang, Herman W. Barkema, J. Trenton McClure

Notice bibliographique

RevueZoonoses and Public Health · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueParasitic Infections and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of CalgaryHealth CanadaBio Food Tech (Canada)University of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesHealth Canada
Mots-clésCryptosporidiumGiardiaTransmission (telecommunications)EpidemiologyZoonotic diseaseBiologyVeterinary medicineMolecular epidemiologyDisease transmissionVirologyEnvironmental healthGeographyFecesMicrobiologyMedicineGeneticsGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To determine the zoonotic potential of Cryptosporidium and Giardia in Prince Edward Island (PEI), Canada, 658 human faecal specimens were screened that were submitted to the Queen Elizabeth Hospital diagnostic laboratory. Overall, 143 (22%) samples were Cryptosporidium positive, while three (0.5%) were positive for Giardia. Successful genotyping of 25 Cryptosporidium isolates by sequence analysis of the HSP70 gene revealed that 28 and 72% were C. hominis and C. parvum, respectively. Cryptosporidium isolates from humans and previously genotyped C. parvum from beef cattle were subtyped by sequence analysis of the GP60 gene. Subtyping identified three subtypes belonging to the family IIa. All three subtypes IIaA16G2RI (55%), IIaA16G3RI (22%) and IIaA15G2RI (22%) were found in the animal isolates, while two of the subtypes found in the animals, IIaA16G2RI (80%) and IIaA15G2RI (20%), were also identified in the human isolates. Cryptosporidium infection in humans peaked in April-June. Molecular epidemiological analysis of the human data showed a C. parvum peak in the spring and a relatively smaller peak for C. hominis in July-September. The majority (57%) of human Cryptosporidium isolates were found in children between 5 and 10 years of age. All three Giardia isolates were identified as G. duodenalis assemblage A. The overall Cryptosporidium prevalence in our human samples was high relative to other studies, but because the samples were submitted to a hospital diagnostic laboratory, the results may not be representative of the general population. Further, the presence of the same zoonotic C. parvum subtypes in cattle and human isolates implies that transmission is largely zoonotic and cattle may be a source of sporadic human infections on PEI. The presence of Giardia in people on PEI is rare, and the assemblage A found in humans might originate from humans, livestock or other domestic or wild animals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,272
Score d'incertitude au seuil0,972

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2012
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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