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Enregistrement W149120575 · doi:10.1096/fasebj.23.1_supplement.lb278

Study of the activity of Estrogen Response Elements present on Pax‐5 promoter and their potential role on regulating Pax‐5 expression in breast cancer

2009· article· en· W149120575 sur OpenAlexaff
Mame Daro Faye, Rodney J. Ouellette

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEstrogen and related hormone effects
Établissements canadiensAtlantic Cancer Research InstituteUniversité de Moncton
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEstrogen receptorCancer researchEstrogenTranscription factorCarcinogenesisBreast cancerBiologyReceptorEstrogen receptor betaOncogeneReporter geneGPERCancerGene expressionEndocrinologyGeneCell cycleGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pax‐5 is a transcription factor playing a crucial role in B lymphopoïesis and its deregulation has been associated to certain malignancies, namely non‐Hodgkin lymphomas and acute lymphoblastic leukemia. Although Pax‐5 is mainly known to be expressed in B cells, there is a body of preliminary data generated in our laboratory suggesting its expression in some breast cancer cell lines and primary breast tumors. In an attempt to explain Pax‐5 expression in these breast cancer cases, we analyzed its promoter and found a number of Estrogen Receptor Elements (EREs) and Estrogen Related Receptors sites (ERRs), suggesting a role for estrogen receptors in Pax‐5 expression in breast cancer. Therefore, electrophoretic mobility shift assays (EMSA) were performed to assess the binding capacity of estrogen receptors ERα and ERβ on those predicted sites, which were also cloned in the Luciferase reporter vector pGL3‐Promoter to evaluate the receptors activity by dual luciferase reporter assays. We report here the specific binding of estrogen receptors on some of the EREs located on Pax‐5 promoter and their differential activation under 17β‐estradiol stimulation in MCF‐7 cells. These results suggest a role for estrogen receptors in the expression of the oncogene Pax‐5 in breast cancer and suggest a mechanism that contributes to breast carcinogenesis. This work has been supported by an ''Atlantic Innovation Fund'' grant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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