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Enregistrement W1491223359 · doi:10.1111/j.1365-2362.2011.02493.x

Strengthening the reporting of genetic risk prediction studies (GRIPS): explanation and elaboration

2011· article· en· W1491223359 sur OpenAlexaff
A. Cecile J.W. Janssens, John P. A. Ioannidis, Sara Bedrosian, Paolo Boffetta, Siobhan M. Dolan, Nicole F. Dowling, Isabel Fortier, Andrew N. Freedman, Jeremy Grimshaw, Jeffrey R. Gulcher, Marta Gwinn, Mark A. Hlatky, Holly Janes, Peter Kraft, Stephanie Melillo, Christopher J. O’Donnell, Michael Pencina, David F. Ransohoff, Sheri D. Schully, Daniela Seminara, Deborah M. Winn, Caroline F. Wright, Cornelia M. van Duijn, Julian Little, Muin J. Khoury

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Clinical Investigation · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueMeta-analysis and systematic reviews
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChecklistMultidisciplinary approachTransparency (behavior)ElaborationCompleteness (order theory)Risk assessmentQuality (philosophy)DiseaseStrengths and weaknessesMedicineComputer scienceData scienceManagement sciencePsychologyPathologyPolitical scienceEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

• The rapid and continuing progress in gene discovery for complex diseases is fuelling interest in the potential application of genetic risk models for clinical and public health practice. • The number of studies assessing the predictive ability is steadily increasing, but they vary widely in completeness of reporting and apparent quality. • Transparent reporting of the strengths and weaknesses of these studies is important to facilitate the accumulation of evidence on genetic risk prediction. • A multidisciplinary workshop sponsored by the Human Genome Epidemiology Network developed a checklist of 25 items recommended for strengthening the reporting of Genetic RIsk Prediction Studies (GRIPS), building on the principles established by prior reporting guidelines. • These recommendations aim to enhance the transparency, quality and completeness of study reporting and thereby to improve the synthesis and application of information from multiple studies that might differ in design, conduct or analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaMétarecherche
Domaine: Présentation des résultats · Genre: Méthodes
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Sans objetlow
gptMétarecherche
Domaine: Présentation des résultats · Genre: Méthodes
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Sans objethigh
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,617
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,846
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: Présentation des résultats
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,383
Score d'incertitude au seuil0,472

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,6170,846
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0050,007
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,013
Bibliométrie0,0160,016
Études des sciences et des technologies0,0030,008
Communication savante0,0080,016
Science ouverte0,0080,015
Intégrité de la recherche0,0170,019
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,910
Tête enseignante GPT0,567
Écart entre enseignants0,343 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Devis d'étudeSans objet
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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