Genetic Variants in <i>GLUT14</i> Gene Enhance Susceptibility to Inflammatory Bowel Disease
Notice bibliographique
Résumé
Oxidative stress is implicated in the initiation and progression of inflammatory bowel disease (IBD). Dehydroascorbic acid (DHA) is actively imported into cells via glucose transporters (GLUTs) and contributes to the vitamin C antioxidant cycle. This study aimed to determine if the recently indentified GLUT 14 gene is associated with susceptibility to IBD and the clinical phenotype. Participants in the population‐based Manitoba IBD Cohort Study were phenotyped using the Montreal classification. Genomic DNA samples from persons with Crohn's disease (CD, n=162) and ulcerative colitis (UC, n=149) and ethnically matched controls (n=142) were genotyped for eight GLUT 14 polymorphisms, using TaqMan assays. Logistic regression was used to determine the case‐control association of genotypes for each polymorphism with CD, UC, and overall IBD risks. Genotype‐phenotype associations were tested by multinomial logistic regression, using SAS software 9.2. Variant rs2889504‐A was associated with increased susceptibility to UC, CD, and overall IBD (OR: 3.60, 95% CI: 1.95‐6.64; OR: 4.68, 95% CI: 2.78, 8.50; OR: 4.14; 95% CI: 2.37‐7.22 respectively). The rs10846086‐G allele was associated with an approximated 3‐fold increased risk of UC, CD, and IBD. Variant rs12815313‐T was associated with increased susceptibility to CD and overall IBD OR: 2.12, 95% CI: 1.33‐3.36; OR: 1.85, 95% CI 2.41 (1.24‐2.77; respectively). These findings provide a novel opportunity toward individualized nutritional therapy for patients carrying the disease‐associated genotype. Further studies are now needed to elucidate the pathogenetic mechanism. (Supported by Peter Eck's Canada Research Chair)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».