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Enregistrement W1493789929 · doi:10.1186/s12907-015-0010-8

Comparison of time-motion analysis of conventional stool culture and the BD MAX™ Enteric Bacterial Panel (EBP)

2015· article· en· W1493789929 sur OpenAlexaboutno aff
Joel E. Mortensen, Cindi Ventrola, Sarah Hanna, Adam Walter

Notice bibliographique

RevueBMC Clinical Pathology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineTurnaround timeMicrobiological cultureClinical microbiologyDiarrheaInternal medicineGastroenterologyMicrobiologyBacteriaBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Conventional bacterial stool culture is one of the more time-consuming tests in a routine clinical microbiology laboratory. In addition, less than 5 % of stool cultures yield positive results. A molecular platform, the BD MAX™ System (BD Diagnostics, Sparks, MD) offers the potential for significantly more rapid results and less hands-on time. Time-motion analysis of the BD MAX Enteric Bacterial Panel (EBP) (BD Diagnostics, Quebec, Canada) on the BD MAX System was compared to conventional stool culture in the microbiology laboratory of a tertiary care pediatric hospital. METHODS: The process impact analysis of time-motion studies of conventional cultures were compared to those of EBP with 86 stool specimens. Sample flow, hands-on time, processing steps, and overall turnaround time were determined and analyzed. Data were obtained and analyzed from both standard operating procedures and direct observation. A regression analysis was performed to ensure consistency of measurements. Time and process measurements started when the specimens were logged into the accessioning area of the microbiology laboratory and were completed when actionable results were generated. RESULTS: With conventional culture, negative culture results were available from 41:14:27 (hours:minutes:seconds) to 54:17:19; with EBP, positive and negative results were available from 2:28:40 to 3:33:39. CONCLUSIONS: This study supports the suggestion that use of the EBP to detect commonly encountered stool pathogens can result in significant time savings and a shorter time-to-result for patients with acute bacterial diarrhea.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,137
Tête enseignante GPT0,402
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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