Molecular Characterization of Carbapenemase Production Among Gram-Negative Bacteria in Saudi Arabia
Notice bibliographique
Résumé
We characterized the molecular basis of carbapenemase production in carbapenem-resistant Gram-negative bacteria isolated from hospitalized patients from Saudi Arabia in the year 2012. Isolates were collected from across the Kingdom and phenotypically tested for carbapenemase production. Polymerase chain reaction detection of carbapenemase genes was also performed. Our results indicate that in Saudi Arabia, OXA-48 and NDM-1 are the dominant carbapenemases among Enterobacteriaceae with low prevalence of VIM. The latter is the most prevalent metallo-beta-lactamase in Pseudomonas aeruginosa, whereas oxacillinases, OXA-23 in particular, are the dominant carbapenemases in Acinetobacter baumannii. No KPC or IMP genes were detected. Our study is the first report of OXA-48, NDM-1, and VIM-4 enzymes in Enterobacter from the Kingdom. Also it is the first report of OXA-72 and NDM-1 in A. baumannii in Saudi Arabia, and the coexistence of blaOXA-23 and blaNDM-1 genes in this species in the country. Awareness of the role of international travel in the spread of carbapenem-resistant determinants in the Kingdom, as well as effective infection control interventions in hospitals and strict antimicrobial stewardship in healthcare facilities and the community are keys to combat the rise of carbapenemase producers in the Kingdom.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».