RARβ involvement in enhancement of lung tumor cell immunogenicity revealed by array analysis
Notice bibliographique
Résumé
The retinoid receptors (RARs and RXRs) are mediators of the multiple effects of retinoic acid. Of these, the retinoic acid receptor beta2 (RARbeta2) has frequently been shown to be the principal mediator of the growth and tumor suppressive effects of retinoic acid; this gene is inactivated in many epithelial tumors and their derived cell lines. We have searched for genes that are regulated by this isoform and are potentially involved in tumor suppression. Using the Atlas human cDNA array I, we identified 27 genes (not counting RARbeta itself) that are regulated, directly or indirectly, by RARbeta2 when it is transfected into Calu-1, a lung tumor-derived line that does not normally express RARbeta. Several of the affected genes code for proteins whose functions would augment the process of apoptosis and/or the host's immune response. The latter group included ICAM-1 and MHC class I heavy chain, whose protein products play particularly important roles in the mounting of an effective anti-tumor response. We then confirmed by flow cytometry that the observed increases in message levels were reflected in increased cell surface protein levels for ICAM-1 and MHC class I in RARbeta2 transfectants of two RARbeta-deficient lines, Calu-1 and the epidermoid lung cancer-derived line SK-MES. Finally, we showed that RARbeta2 transfection of Calu-1 cells enhanced the heterologous CTL response in both the induction and the effector phases by up to threefold. These results support the hypothesis that down-regulation of these genes (and possibly others) in RARbeta-deficient tumor cells contributes to immune system evasion, and suggest a novel therapeutic approach for this disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».