MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1495765010 · doi:10.1111/j.1747-0285.2006.00330.x

Nuclear magnetic resonance studies of CXC chemokine receptor 4 allosteric peptide agonists in solution

2005· article· en· W1495765010 sur OpenAlexaff
Olga K. Baryshnikova, Jan K. Rainey, Brian D. Sykes

Notice bibliographique

RevueJournal of Peptide Research · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChemokine receptors and signaling
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAllosteric regulationPeptideChemistryReceptorStereochemistryBiophysicsBiochemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract: CXC chemokine receptor 4 (CXCR4) is an important pharmacological target due to its involvement in HIV‐1 pathogenesis and cancer metastasis. Two recently discovered allosteric agonists that bind and activate CXCR4, the ASLW and RSVM peptides, were analyzed using solution nuclear magnetic resonance spectroscopy. Both peptides assumed an extended backbone conformation with several well‐defined local motifs in the regions from residues 5 to 8 and 9 to 12. The local structures in the region of residues 5–8 were different for agonists studied here and natural ligands. The local structure in the region 9–12 was adopted by the entire ensemble of the ASLW peptide structures and by the subset of conformations for the RSVM peptide. The same turn was found in full‐length stromal derived factor (SDF)‐1 and in the small family of the SDF‐1 N‐terminal 17‐mer. Similar examples in literature suggest the relevance of nascent structures in peptides to their biologically relevant conformations. The significance of found local structures and implications for further drug design are discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,521
Score d'incertitude au seuil0,690

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,094
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Peptide ResearchMême sujetChemokine receptors and signalingTravaux en français237 207