Nuclear magnetic resonance studies of CXC chemokine receptor 4 allosteric peptide agonists in solution
Notice bibliographique
Résumé
Abstract: CXC chemokine receptor 4 (CXCR4) is an important pharmacological target due to its involvement in HIV‐1 pathogenesis and cancer metastasis. Two recently discovered allosteric agonists that bind and activate CXCR4, the ASLW and RSVM peptides, were analyzed using solution nuclear magnetic resonance spectroscopy. Both peptides assumed an extended backbone conformation with several well‐defined local motifs in the regions from residues 5 to 8 and 9 to 12. The local structures in the region of residues 5–8 were different for agonists studied here and natural ligands. The local structure in the region 9–12 was adopted by the entire ensemble of the ASLW peptide structures and by the subset of conformations for the RSVM peptide. The same turn was found in full‐length stromal derived factor (SDF)‐1 and in the small family of the SDF‐1 N‐terminal 17‐mer. Similar examples in literature suggest the relevance of nascent structures in peptides to their biologically relevant conformations. The significance of found local structures and implications for further drug design are discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».