Abstract 4372: MiR-449a promotes breast cancer progression by activating the NF-κB pathway
Notice bibliographique
Résumé
Abstract INTRODUCTION MicroRNAs (miRs) have been implicated in various human malignancies and are being developed as diagnostic, predictive, and prognostic biomarkers. Our previous global profiling studies found miR-449a to be over-expressed in archival lymph node-negative invasive ductal breast carcinoma samples (n=74) when compared to normal tissues. Furthermore, miR-449a expression level was significantly associated with relapse. The mechanism(s) by which miR-449a functions remains unknown, and the aim of the current study was therefore to elucidate the roles and mRNA targets of miR-449a in breast cancer. MATERIAL AND METHODS MiR-449a expression was evaluated in six human breast cancer cell lines (T47D, MDA-MB-468, MDA-MB-231, MCF-7, MDA-MB-453, and ZR75-1). Three of these cell lines, T47D, MMDA-MB-468, and MDA-MB-231, were selected and used to assess the biological effects of miR-449a on cell viability, clonogenicity, cell migration, and invasion. Downstream target genes were identified by combining in silico miRWalk prediction and cell line/patient sample microarray data. Targets were validated using qRT-PCR and luciferase reporter assays. RESULTS Consistent with our global profiling work, several (4/6) of the tested breast cancer cell lines over-expressed miR-449a. CDC20B, the miR-449a host gene and an essential regulator of cell division, was also over-expressed. Knockdown of miR-449a resulted in significantly decreased cell viability, clonogenic survival, migration, and invasion. MiR-449a candidate targets were then identified by integrating in silico prediction algorithms, cell line mRNA expression profiling (Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0), and clinical specimen mRNA expression data. Two genes, CRIP2 (Cysteine rich protein 2, a transcription factor) and PRKAG1 (Protein Kinase, AMP-Activated, Gamma 1 Non-Catalytic), were verified as miR-449a targets using qRT-PCR. Moreover, direct interactions between miR-449a and the 3′-UTRs of both CRIP2 and PRKAG1 were confirmed using luciferase reporter assays. Inhibition of CRIP2 by miR-449a allowed for NF-κB-induced transcription of survival, proliferation, and growth-related genes, providing further evidence for the role of miR-449a in breast cancer progression. CONCLUSIONS MiR-449a is over-expressed in breast cancer cells, promoting cellular proliferation, migration, and invasion. One mechanism by which miR-449a functions is to down-regulate CRIP2, leading to NF-kB activation and possible cancer progression. Further investigations into gene regulation by miR-449a may reveal other promising targets for the management of breast cancer. Citation Format: Wei Shi, Matthew Lee, Ryunosuke Kogo, Jeff Bruce, Christine How, Kenneth W. Yip, Fei-Fei Liu. MiR-449a promotes breast cancer progression by activating the NF-κB pathway. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 4372. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-4372
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».