Characterization of novel structural features in the lipopolysaccharide of nondisease associated nontypeable <i>Haemophilus influenzae</i>
Notice bibliographique
Résumé
Nontypeable Haemophilus influenzae (NTHi) is a common commensal of the human upper respiratory tract and is associated with otitis media in children. The structures of the oligosaccharide portions of NTHi lipopolysaccharide (LPS) from several otitis media isolates are now well characterized but it is not known whether there are structural differences in LPS from colonizing, nondisease associated strains. Structural analysis of LPS from nondisease associated NTHi strains 11 and 16 has been achieved by the application of high-field NMR techniques, ESI-MS, ESI-MSn, capillary electrophoresis coupled to ESI-MS, composition and linkage analyses on O-deacylated LPS and core oligosaccharide material. This is the first study to report structural details on LPS from strains taken from the nasopharynx from healthy individuals. Both strains express identical structures and contain the common element of H. influenzae LPS, L-alpha-D-Hepp-(1-->2)-[PEtn-->6]-L-alpha-D-Hepp-(1-->3)-[beta-D-Glcp-(1-->4)]-L-alpha-D-Hepp-(1-->5)-[PPEtn-->4]-alpha-Kdop-(2-->6)-lipid A, in which each heptose is elongated by a single hexose residue with no further oligosaccharide extensions. In the major Hex3 glycoform, the terminal Hepp residue (HepIII) is substituted at the O-2 position by a beta-D-Galp residue and the central Hepp residue (HepII) is substituted at O-3 by a alpha-D-Glcp residue. Notably, the strains express two phosphocholine (PCho) substituents, one at the O-6 position of alpha-D-Glcp and the other at the O-6 position of beta-D-Galp. Major acetylation sites were identified at O-4 of Gal and O-3 of HepIII. Additionally, both strains express glycine, and strain 11 also expresses detectable amounts of N-acetylneuraminic acid.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».