Heat‐induced degrons and the co‐chaperone Ydj1‐adaptor mediate the ubiquitination of misfolded proteins by the Rsp5 ubiquitin ligase upon stress (558.1)
Notice bibliographique
Résumé
The ubiquitin proteasome system is critical for the prompt elimination of misfolded proteins, which pose a deleterious risk to the cell. Indeed numerous diseases are associated with protein misfolding and aggregation. The heat‐shock response mediates several cellular events to prevent accumulation of misfolded proteins including upregulation of heat‐shock proteins and increased proteolysis. We found that upon heat‐stress Rsp5 is the main E3 ligase that ubiquitinates cytosolic misfolded proteins to target them for proteasome degradation. Notably, degradation of misfolded proteins is dependent on both Ubp2 and Ubp3 deubiquitinases. The absence of either deubiquitinase leads to reduced cell fitness upon misfolding stresses. We also found that the association of Rsp5 with the Hsp40 co‐chaperone Ydj1 increases upon stress and that association is required for the ubiquitination of heat‐induced Rsp5 substrates. In addition, PY Rsp5‐binding motifs are also enriched among heat‐induced Rsp5 substrates and found primarily in structured regions, often less accessible. Our results support a bipartite recognition mechanism combining chaperone‐dependent and heat‐induced degrons that mediate ubiquitination of cytosolic misfolded proteins by Rsp5.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».