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Enregistrement W1498789110 · doi:10.1158/1538-7445.am2014-4369

Abstract 4369: The microRNA-218-survivin axis regulates cervical cancer cell migration and invasion

2014· article· en· W1498789110 sur OpenAlexaff
Ryunosuke Kogo, Christine How, Jeff Bruce, Willa Shi, Kenneth W. Yip, Laurie Ailles, Fei‐Fei Liu

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSurvivinClonogenic assayTransfectionGene knockdownmicroRNACancer researchBiologyCervical cancerMolecular biologyCellCancerCell cultureGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract MicroRNA (miR)-218 down-regulation has been reported in numerous human malignancies. In cervical cancer, we identified that lower miR-218 expression was significantly associated with poorer overall survival, disease-free survival, and pelvic/para-aortic lymph node recurrence. Further analyses of cervical cancer data from The Cancer Genome Atlas (TCGA) identified that this down-regulation was associated with a genomic locus loss (hsa-mir-218-1:4p15.31, hsa-mir-218-2:5q34, n=105). The objective of the current study was to elucidate the cellular and molecular functions of miR-218. MiR-218 transfection into cervical cancer cells (SiHa and ME-180) significantly reduced cell migration (by 66% and 89%, respectively), invasion (by 49% and 67%, respectively), and clonogenic capacity (by 42% and 53%, respectively), relative to control-transfected cells (P<0.05). In order to identify clinically relevant miR-218 target genes, we used an integrated trimodal approach, incorporating DNA microarray (Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0) analyses of 79 clinical samples, miR-218 transfection, and miRDB target prediction. The most significant target was survivin (BIRC5); miR-218 transfection confirmed a reduction in survivin mRNA and protein expression in both SiHa and ME-180 cells. Furthermore, a direct interaction between the survivin-3′UTR and miR-218 was validated using a luciferase reporter assay. siRNA knockdown of survivin in SiHa and ME-180 significantly reduced cell migration (by 76% and 83%, respectively), invasion (by 79% and 88%, respectively), and clonogenic capacity (by 98% and 97%, respectively), relative to control cells (P<0.05). YM155, a small-molecule survivin suppressant, effectively reduced survivin mRNA and protein levels in a concentration- and time-dependent manner. This compound correspondingly decreased cervical cancer cell proliferation and clonogenic survival. Our results suggest that the miR-218-survivin axis plays an important role in cervical cancer progression. Citation Format: Ryunosuke Kogo, Christine How, Jeff Bruce, Willa Shi, Kenneth W. Yip, Laurie Ailles, Fei-Fei Liu. The microRNA-218-survivin axis regulates cervical cancer cell migration and invasion. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 4369. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-4369

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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