MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1498792559 · doi:10.20381/ruor-3739

Applying Supervised Learning Algorithms and a New Feature Selection Method to Predict Coronary Artery Disease

2014· preprint· en· W1498792559 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueuO Research (University of Ottawa) · 2014
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueImbalanced Data Classification Techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRandom forestFeature selectionArtificial intelligencePattern recognition (psychology)Classifier (UML)Feature vectorDimensionality reductionReceiver operating characteristicComputer scienceAlgorithmMathematicsMachine learning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

From a fresh data science perspective, this thesis discusses the prediction of coronary artery disease based on Single-Nucleotide Polymorphisms (SNPs) from the Ontario Heart Genomics Study (OHGS). First, the thesis explains the k-Nearest Neighbour (k-NN) and Random Forest learning algorithms, and includes a complete proof that k-NN is universally consistent in finite dimensional normed vector spaces. Second, the thesis introduces two dimensionality reduction techniques: Random Projections and a new method termed Mass Transportation Distance (MTD) Feature Selection. Then, this thesis compares the performance of Random Projections with k-NN against MTD Feature Selection and Random Forest for predicting artery disease. Results demonstrate that MTD Feature Selection with Random Forest is superior to Random Projections and k-NN. Random Forest is able to obtain an accuracy of 0.6660 and an area under the ROC curve of 0.8562 on the OHGS dataset, when 3335 SNPs are selected by MTD Feature Selection for classification. This area is considerably better than the previous high score of 0.608 obtained by Davies et al. in 2010 on the same dataset.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,874
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle