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Enregistrement W150103801 · doi:10.1096/fasebj.22.1_supplement.810.1

Protein Scaffolds for Multivalent Display of High‐Affinity CD22 Ligands

2008· article· en· W150103801 sur OpenAlexaff
Mary K. O’Reilly, Liang Liao, Cory D. Rillahan, Brian E. Collins, Shoufa Han, Pavel I. Kitov, David R. Bundle, James C. Paulson

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensAlberta Glycomics CentreUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCD22ChemistryLigand (biochemistry)GlycanLectinFlow cytometryBiochemistryMolecular biologyReceptorGlycoproteinCellBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CD22 is a sialic acid‐binding immunoglobulin‐like lectin (Siglec) that is expressed on the surface of B cells and functions as a regulator of B cell receptor signaling. The relationship between glycan binding and immunomodulatory function is being explored, and has led to the development of ligand‐based probes of CD22. CD22 binds to glycan ligands bearing the terminal sequence NeuAcα2‐6Gal with low affinity (K d = ~0.2 mM), requiring multivalency to achieve stable binding. We have used a decavalent anti‐nitrophenol (NP) IgM antibody to display hetero‐bi‐functional ligands comprising a CD22 ligand coupled to the antigen NP. In this approach the protein scaffold participates in ligand‐driven assembly of multivalent IgM‐CD22 complexes, which can be demonstrated on immobilized recombinant CD22 by ELISA or flow cytometry of CD22‐immobilized magnetic beads. More importantly, assembly is observed on the surface of native B cells, as detected by immunofluorescence and flow cytometry, even though the ligand‐binding site of CD22 is largely masked by endogenous glycan ligands on the cell surface. This assembly is sensitive to the length and structure of the spacer, and also to the valency of the scaffold, as anti‐NP IgA and IgG display decreased avidity compared to anti‐NP IgM. The observation that a divalent protein scaffold succeeds where synthetic probes of higher valency do not validates this approach.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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