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Enregistrement W1501086754 · doi:10.1111/j.1460-9568.2004.03703.x

Isolation of an mRNA binding protein homologue that is expressed in nociceptors

2004· article· en· W1501086754 sur OpenAlexaboutno aff
Helge Eilers, Sharon L. Trilk, Sook‐Young Lee, Qing Xue, Beverly E. Jong, Irene Moff, Jon D. Levine, Mark Schumacher

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Neuroscience · 2004
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacological Effects of Natural Compounds
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial Research
Mots-clésMessenger RNAIsolation (microbiology)NociceptorCell biologyMolecular biologyChemistryBiologyGeneticsGeneBioinformaticsNociceptionReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The peripheral detection of painful stimuli requires the activation of small-diameter primary afferent neurons known as nociceptors. We have exploited two features of nociceptor biology, expression of the high affinity receptor for nerve growth factor (TrkA) and sensitivity to capsaicin, to isolate novel proteins using a differential display cloning scheme. A resulting approximately 4.3-kb cDNA was isolated and sequence analysis inferred a approximately 157-kDa protein containing a signal/mitochondrial targeting peptide sequence. Due to its molecular weight and significant amino acid identity with 'human leucine-rich protein 130'[leucine-rich pentatricopeptide motif containing (LRPPRC)], we termed the cDNA candidate leucine-rich protein 157 (rLRP157). Western blot analysis of HEK293 cells over-expressing the candidate cDNA showed a single protein product of similar size to that found in rat dorsal root ganglion as well as in other neuronal tissues and cell lines. Although expressed in a wide variety of tissues, in situ hybridization and immunohistochemistry in dorsal root ganglion revealed that rLRP157 expression was restricted to the small-diameter neurons. Sequence identity with previously characterized mRNA binding proteins and its subcellular localization in sensory neurons suggest that rLRP157 is associated with mitochondrial function. Moreover, the genetic basis of French-Canadian Leigh syndrome, which confers a loss of mitochondrial cytochrome c oxidase and is characterized by neurodegeneration, was recently mapped to a mutation in the LRPPRC gene. Taken together with its expression in small-diameter sensory neurons, we hypothesize that rLRP157, the rat orthologue of the human LRPPRC, may play a role in the modulation of peripheral pain transduction and serve as a novel marker for nociceptor subtypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,068
Score d'incertitude au seuil0,635

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,136
Tête enseignante GPT0,406
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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