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Enregistrement W1501719967 · doi:10.1046/j.1432-1033.2002.03315.x

The effects of ring‐size analogs of the antimicrobial peptide gramicidin S on phospholipid bilayer model membranes and on the growth of <i>Acholeplasma laidlawii</i> B

2002· article· en· W1501719967 sur OpenAlexaff
Mónika Kiricsi, Elmar J. Prenner, Masood Jelokhani‐Niaraki, Ruthven N.A.H. Lewis, Robert S. Hodges, Ronald N. McElhaney

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Biochemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensWilfrid Laurier UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhospholipidVesiclePhosphatidylethanolamineGramicidinChemistryPhosphatidylcholineBilayerMembraneRing sizePeptidePhosphatidylglycerolBiophysicsLipid bilayerGramicidin SBiochemistryBiologyRing (chemistry)Organic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have examined the effects of three ring-size analogs of the cyclic beta-sheet antimicrobial peptide gramicidin S (GS) on the thermotropic phase behavior and permeability of phospholipid model membranes and on the growth of the cell wall-less Gram-positive bacteria Acholeplasma laidlawii B. These three analogs have ring sizes of 10 (GS10), 12 (GS12) or 14 (GS14) amino acids, respectively. Our high-sensitivity differential scanning calorimetric studies indicate that all three of these GS analogs perturb the gel/liquid-crystalline phase transition of zwitterionic phosphatidylcholine (PtdCho) vesicles to a greater extent than of zwitterionic phosphatidylethanolamine (PtdEtn) or of anionic phosphatidylglycerol (PtdGro) vesicles, in contrast to GS itself, which interacts more strongly with PtdGro than with PtdCho and PtdEtn bilayers. However, the relative potency of the perturbation of phospholipid phase behavior varies markedly between the three peptides, generally decreasing in the order GS14 > GS10 > GS12. Similarly, these three GS ring-size analogs also differ considerably in their ability to cause fluorescence dye leakage from phospholipid vesicles, with the potency of permeabilization also generally decreasing in the order GS14 > GS10 > GS12. Finally, these GS ring-size analogs also differentially inhibit the growth of A. laidlawii with growth inhibition also decreasing in the order GS14 > GS10 > GS12. These results indicate that the relative potencies of GS and its ring-size analogs in perturbing the organization and increasing the permeability of phospholipid bilayer model membranes, and of inhibiting the growth of A. laidlawii B cells, are at least qualitatively correlated, and provide further support for the hypothesis that the primary target of these antimicrobial peptides is the lipid bilayer of the bacterial membrane. The very high antimicrobial activity of GS14 against the cell wall-less bacteria A. laidlawii as compared to various conventional bacteria confirms our earlier suggestion that the avid binding of this peptide to the bacterial cell wall is primarily responsible for its reduced antimicrobial activity against such organisms. The relative magnitude of the effects of GS itself, and of the three ring-size GS analogs, on phospholipid bilayer organization and cell growth correlate relatively well with the effective hydrophobicities and amphiphilicities of these peptides but less well with their relative charge density, intrinsic hydrophobicities or conformational flexibilities. Nevertheless, all of these parameters, as well as others, may influence the antimicrobial potency and hemolytic activity of GS analogs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,429

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,177
Écart entre enseignants0,170 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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