Polymorphisms of the gene encoding Kit ligand are associated with bronchopulmonary dysplasia
Notice bibliographique
Résumé
Bronchopulmonary dysplasia (BPD) is a chronic inflammatory lung disease that affects infants born preterm. Family studies indicate that BPD has a significant genetic component. RATIONALE: We assessed the gene encoding Kit ligand (KITLG) as a candidate for genetic predisposition to moderate-to-severe BPD (controls were infants with no or mild BPD). STUDY DESIGN: Eight KITLG-tagging single nucleotide polymorphisms (SNPs) were analyzed in cohorts of very preterm infants originating from northern Finland (56 cases and 197 controls), southern Finland (n = 59 + 52), and Canada (n = 58 + 68). Additional replication populations included infants born in Finland (n = 41 + 241) and Hungary (n = 29 + 40). All infants were of European origin. Results were controlled for risk factors of BPD. Kit ligand concentration in umbilical cord blood, collected from very preterm infants (n = 120), was studied. RESULTS: Six SNPs of KITLG and a haplotype including all eight genotyped SNPs were associated with moderate-to-severe BPD in the northern Finnish population. When all the populations were combined, SNP rs11104948 was significantly associated with BPD. Kit ligand concentration in umbilical cord blood of infants born very preterm was an independent risk factor of BPD. CONCLUSIONS: We show that KITLG polymorphisms are associated with susceptibility to moderate-to-severe BPD. In addition, higher Kit ligand concentrations were observed in infants that subsequently developed BPD. These results support the possibility that KITLG gene is involved in predisposition to BPD. Pediatr Pulmonol. 2015; 50:260-270. © 2014 Wiley Periodicals, Inc.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».