The placement of <i>Gyrodactylus salmonis</i> (Yin & Sproston) in the molecular phylogeny of studied members of the <i>Gyrodactylus wageneri</i>‐group parasitizing salmonids
Notice bibliographique
Résumé
The molecular phylogeny of Gyrodactylus salmonis from brook charr, Salvelinus fontinalis, rainbow trout, Oncorhynchus mykiss, cutthroat trout, O. clarkii, and Atlantic salmon, Salmo salar, in Canada is presented using sequences from ITS-rDNA and the mitochondrial COX 1 gene. Sequence variation among G. salmonis specimens from the different North American hosts was consistent with within-species variation reported for other Gyrodactylus. Sequence data are compared to those from other members of the wageneri group parasitizing salmoniform fishes in northern Europe (G. derjavini, G. derjavinoides, G. lavareti, G. salaris, G. salvelini, G. teuchis and G. truttae) and Asia (G. brachymystacis). Sequence divergence between G. salmonis and the recently described G. salvelini on Arctic charr, Salvelinus alpinus, in Finland was consistent with within-species levels of variation in Gyrodactylus; however, phylogenetic analyses and morphological comparisons provided evidence of their distinctiveness such that they appear to be sister species. They grouped with G. lavareti (a parasite of a coregonid) to form a clade separate from European and Asian species of the wageneri lineage known from salmonid fish. Further study of gyrodactylids from across salmonid, coregonid and thymallid fish in the northern hemisphere would shed more light on the phylogeography of these parasites and serves as an important backdrop to understanding the evolution of their emergent virulence.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».