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Enregistrement W1505034420 · doi:10.1109/qels.1999.807650

Diffractive optics-based nonlinear spectroscopy: application to the study of deterministic protein motion

2003· article· en· W1505034420 sur OpenAlexaff
Gami Dadusc, Jennifer P. Ogilvie, Gregory D. Goodno, V. Astinov, R. J. Dwayne Miller

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueSpectroscopy and Quantum Chemical Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhysicsFemtosecondOpticsRelaxation (psychology)Degrees of freedom (physics and chemistry)Refractive indexStability (learning theory)Computer scienceQuantum mechanicsLaser

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary form only given. Biological systems constantly transduce various forms of chemical energy into functions in which the inherent response of the system operates at the edge of stability. Excursions from the stability region lead to denaturation; whereas small fluctuations about the stability point lead to highly correlated responses that behave in a deterministic fashion with respect to the function of the system. Exactly how is the bond energy directed in such a complex system and how has the system evolved to minimize entropic losses in conversion efficiency? We have used the oxygen binding heme proteins as model systems for studying the coupling of reaction forces to functionally relevant motions; i.e., structural transitions important to the self regulation of oxygen binding and transport. Since the forces involved become spatially distributed over an enormous number of degrees of freedom, the net relative motions can be exceedingly small (<.1 /spl Aring/). A very sensitive method is needed to detect these motions and the time resolution must be sufficient to follow from the very first events of bond breaking to full relaxation. The use of diffractive optics for the implementation of heterodyne detected grating spectroscopy has recently been demonstrated. The diffractive optic also generates tilted phase fronts to provide true femtosecond time resolution in noncollinear geometries. This approach has sufficient time resolution and sensitivity to follow the mass displacement, as connected through changes in the material index of refraction, to address this issue.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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