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Enregistrement W1505547045 · doi:10.1002/9780470062128.ch12

The AcB/BcA Recombinant Congenic Strains of Mice: Strategies for Phenotype Dissection, Mapping and Cloning of Quantitative Trait Genes

2006· review· en· W1505547045 sur OpenAlexaff
Anny Fortin, Eduardo Diez, Janet E. Henderson, Jeffrey S. Mogil, Philippe Gros, Emil Skamene

Notice bibliographique

RevueNovartis Foundation symposium · 2006
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcGill UniversityCollège de Maisonneuve
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCongenicBiologyGeneticsQuantitative trait locusPhenotypeGeneGene mappingGenomeInbred strainGenetic linkagePositional cloningAlleleCandidate geneComputational biologyChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The AcB/BcA gene discovery platform consists of a series of 36 recombinant congenic strains (RCS) produced from the second backcross generation of the progenitor mouse strains A/J and C57BL/6J. Each individual inbred RCS carries 12.5% of the donor genome in 87.5% of the background genome. As the two parental strains are known to vary in the expression of resistance and susceptibility to a considerable number of mouse models of human diseases, the AcB/BcA RCS platform represents a valuable and versatile genetic tool to study many different phenotypes. RCS can be used to follow the segregation of single gene effects in individual strains, or to look at association/dissociation of mechanistic aspects of complex phenotypes. In addition, one can select strains with fixed alleles at known loci to look for novel gene effects, or use strains with overlapping congenic segments to delineate minimal QTL, intervals. The AcB/BcA RCS platform was used by our group and others to study a series of complex phenotypes including nociception, malaria susceptibility and lipid metabolism. Linkage mapping in secondary crosses and gene expression analysis in targeted organs allowed the identification of chromosomal regions, genes, and biological pathways which might unravel novel targets for preventive and therapeutic interventions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,993
Score d'incertitude au seuil0,649

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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