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Enregistrement W1505923380 · doi:10.1111/j.1742-4658.2005.04612.x

Induction of raft‐like domains by a myristoylated NAP‐22 peptide and its Tyr mutant

2005· article· en· W1505923380 sur OpenAlexafffund
Brian G. Sayer, Richard M. Epand

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPeptideMyristoylationChemistryBilayerAmino acidLipid bilayerPeptide sequenceResidue (chemistry)BiochemistryBiophysicsStereochemistryMembraneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The N-terminally myristoylated, 19-amino acid peptide, corresponding to the amino terminus of the neuronal protein NAP-22 (NAP-22 peptide) is a naturally occurring peptide that had been shown by fluorescence to cause the sequestering of a Bodipy-labeled PtdIns(4,5)P2 in a cholesterol-dependent manner. The present work, using differential scanning calorimetry (DSC), extends the observation that formation of a PtdIns(4,5)P2-rich domain is cholesterol dependent and shows that it also leads to the formation of a cholesterol-depleted domain. The PtdIns(4,5)P2 used in the present work is extracted from natural sources and does not contain any label and has the native acyl chain composition. Peptide-induced formation of a cholesterol-depleted domain is abolished when the sole aromatic amino acid, Tyr11 is replaced with a Leu. Despite this, the modified peptide can still sequester PtdIns(4,5)P2 into domains, probably because of the presence of a cluster of cationic residues in the peptide. Cholesterol and PtdIns(4,5)P2 also modulate the insertion of the peptide into the bilayer as revealed by 1H NOESY MAS/NMR. The intensity of cross peaks between the aromatic protons of the Tyr residue and the protons of the lipid indicate that in the presence of cholesterol there is a change in the nature of the interaction of the peptide with the membrane. These results have important implications for the mechanism by which NAP-22 affects actin reorganization in neurons.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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