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Enregistrement W1506114605 · doi:10.5555/afhs.2007.7.2.68

Organisms associated with bacterial vaginosis in Nigerian women as determined by PCR-DGGE and 16S rRNA gene sequence.

2007· article· en· W1506114605 sur OpenAlexaff
Kingsley C. Anukam, Gregor Reid

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensLawson Health Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBacterial vaginosisMedicineMicrobiologyGenBankGardnerella vaginalisVaginaMycoplasma hominisPolymerase chain reactionBiologyMycoplasmaVirologyGeneGeneticsSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Bacterial vaginosis (BV) is a condition with diverse etiology. This condition predisposes women to increased susceptibility to sexually transmitted diseases, including human immunodeficiency virus (HIV) infections and preterm birth. The diagnostic methods currently adopted in the evaluation of patient samples for BV are arguably Amsel criteria, and Nugent score that require microscopy and expert interpretation. These two methods are still subjective. OBJECTIVE: The objective of this study was to determine the organisms present in the vagina of 34 HIV negative Nigerian women diagnosed as having bacterial vaginosis by using molecular techniques. METHODS: The vaginal samples were subjected to DNA extraction, and amplified with eubacterial primers via PCR. The PCR products were separated using denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). Bands were excised, re-amplified, purified and sequenced. Sequence identification was performed using the BLAST algorithm and Genbank data base. RESULTS: Mycoplasma hominis (12/34; 35%) was the most common isolate and 9 (26%) contained one of two clones of an unusual Rainbow Trout intestinal bacterium, while unculturable Streptococcus sp, and other bacteria made up the remaining isolates. CONCLUSIONS: The findings indicate further diversity in the etiological agents associated with BV, and raise the question as to whether diagnosis and management of this condition needs to be re-evaluated in countries like Nigeria. There is some controversy over the clinical importance of BV, as it was once regarded as a disease caused by Gardnerella and presenting as an odourous discharge condition, but is now diagnosed without necessarily the presence of these organisms or signs. With the incidence of BV aligned to an increased risk of HIV in a country ravaged by this virus, the effective eradication of BV can only be achieved if appropriate therapies are delivered.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,544
Score d'incertitude au seuil0,642

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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