MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1506525888 · doi:10.1002/ece3.31

Postglacial recolonization of eastern Blacknose Dace, <i>Rhinichthys atratulus</i> (Teleostei: Cyprinidae), through the gateway of New England

2011· article· en· W1506525888 sur OpenAlexaboutno aff
Michelle L. Tipton, Sarah Gignoux‐Wolfsohn, Phoebe Stonebraker, Barry Chernoff

Notice bibliographique

RevueEcology and Evolution · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. Geological SurveyNew York State Department of Environmental ConservationAndrew W. Mellon Foundation
Mots-clésRange (aeronautics)EcologyPopulationGlacierDrainage basinBiological dispersalBiologyGeographyPhysical geographyDemographyCartography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During the last ice age, much of North America far south as 40°N was covered by glaciers (Hewitt 2000). About 20,000 years ago, as the glaciers retreated, the hydrologic landscape changed dramatically creating waterways for fish dispersal. The number of populations responsible for recolonization and the regions from which they recolonized are unknown for many freshwater fishes living in New England and southeastern Canada. The Blacknose Dace,Rhinichthys atratulus, is one of the freshwater fish species that recolonized this region. We hypothesize that the earliest deglaciated region, modern-day Connecticut, was recolonized byR. atratulusvia a single founding event by a single population. In this paper, we test this hypothesis phylogenetically with regard to the major drainage basins within Connecticut. The mitochondrial DNA exhibits low nucleotide diversity, high haplotype diversity, and a dominant haplotype found across the state. A small percentage of individuals in the Housatonic drainage basin, however, share a haplotype with populations in New York drainage basins, a haplotype not found elsewhere in Connecticut's drainage basins. We calculated a range for the rate of divergence for NADH dehydrogenase subunit 2 (nd2) and control region (ctr) of 4.43-6.76% and 3.84-8.48% per million years (my), respectively. While this range is higher than the commonly accepted rate of 2% for mitochondrial DNA, these results join a growing list of publications finding high rates of divergence for various taxa (Peterson and Masel 2009). The data support the conclusion that Connecticut as a whole was recolonized initially by a single founding event that came from a single refugium. Subsequently, the Housatonic basin alone experienced a secondary recolonization event.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,093

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEcology and EvolutionMême sujetGenetic diversity and population structureTravaux en français237 207