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Enregistrement W1506846738 · doi:10.1111/j.1365-2672.2012.05301.x

Characterization of a mobile and multiple resistance plasmid isolated from swine manure and its detection in soil after manure application

2012· article· en· W1506846738 sur OpenAlexafffund
Teddie O. Rahube, Christopher K. Yost

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Microbiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePharmaceutical and Antibiotic Environmental Impacts
Établissements canadiensUniversity of Regina
Organismes subventionnairesInternational University for Science and TechnologyNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsBotswana International University of Science and Technology
Mots-clésPlasmidManureTetracyclineBiologyMobile genetic elementsMicrobiologyEscherichia coliMicrobial inoculantAntibiotic resistanceGeneAntibioticsBacteriaGeneticsAgronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: To isolate and characterize multiple antibiotic resistance plasmids found in swine manure and test for plasmid-associated genetic markers in soil following manure application to an agricultural field. METHODS AND RESULTS: Plasmids were isolated from an erythromycin enrichment culture that used liquid swine manure as an inoculant. Plasmids were transformed into Escherichia coli DH10β for subsequent characterization. We isolated and DNA sequenced a 22 102-bp plasmid (pMC2) that confers macrolide, and tetracycline resistances, and carries genes predicted to code for mercury and chromium resistance. Conjugation experiments using an pRP4 derivative as a helper plasmid confirm that pMC2 has a functional mobilization unit. PCR was used to detect genetic elements found on pMC2 in DNA extracted from manure amended soil. CONCLUSIONS: The pMC2 plasmid has a tetracycline-resistant core and has acquired additional resistance genes by insertion of an accessory region (12 762 bp) containing macrolide, mercury and chromium resistance genes, which was inserted between the truncated DDE motifs within the Tn903/IS102 mobile element. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: Liquid swine manure used for manure spreading contains multiple antibiotic resistance plasmids that can be detected in soil following manure application.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,182
Score d'incertitude au seuil0,309

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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