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Enregistrement W1507152277 · doi:10.1046/j.1432-1033.2002.02986.x

Molecular mechanisms underlying <i>SHP‐1</i> gene expression

2002· article· en· W1507152277 sur OpenAlexaff
Hing Wo Tsui, Kathleen T Hasselblatt, Alberto Martín, Samuel C. Mok, Florence Wing Ling Tsui

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Biochemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPromoterProtein tyrosine phosphataseTranscription factorGeneMolecular biologyUntranslated regionRegulation of gene expressionGene expressionSignal transductionCell biologyGeneticsMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SHP-1, a protein-tyrosine phosphatase with two src-homology 2 domains, is expressed predominantly in hematopoietic and epithelial cells and has been implicated in numerous signaling pathways as a negative regulator. Two promoters direct the expression of human and murine SHP-1, and two types of transcripts (I) and (II) SHP-1, are initiated from each of these promoters. The cDNA sequences of (I)SHP-1 and (II)SHP-1 are identical except in the 5' untranslated region and in the first few coding nucleotides. In this report, we show that promoter usage is similar in mouse and human hematopoietic cells, but different in epithelial cells. In human epithelial cells, only (I)SHP-1 transcripts were expressed. In addition, 4beta-phorbol 12-myristate 13-acetate up-regulates human (I)SHP-1 transcript expression in SKOV3 cells (an ovarian cancer cell line). Indirect evidence suggests that nuclear factor-kappaB might play a role in this induction. We also show that a 12-bp repeat in the distal SHP-1 promoter, which directs (I)SHP-1 expression, is of functional relevance as deletion of one copy of this E-box-containing 12-bp repeat resulted in a significant decrease in promoter activity. Electrophoretic mobility shift assays and supershift experiments showed that the upstream stimulatory factors USF1 and USF2 hetero-dimerize and interact with this 12 bp repeat. Our results suggest that USFs which have antiproliferative functions might regulate the expression of SHP-1, which itself is predominantly a negative growth regulator.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,124
Score d'incertitude au seuil0,814

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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