Molecular mechanisms underlying <i>SHP‐1</i> gene expression
Notice bibliographique
Résumé
SHP-1, a protein-tyrosine phosphatase with two src-homology 2 domains, is expressed predominantly in hematopoietic and epithelial cells and has been implicated in numerous signaling pathways as a negative regulator. Two promoters direct the expression of human and murine SHP-1, and two types of transcripts (I) and (II) SHP-1, are initiated from each of these promoters. The cDNA sequences of (I)SHP-1 and (II)SHP-1 are identical except in the 5' untranslated region and in the first few coding nucleotides. In this report, we show that promoter usage is similar in mouse and human hematopoietic cells, but different in epithelial cells. In human epithelial cells, only (I)SHP-1 transcripts were expressed. In addition, 4beta-phorbol 12-myristate 13-acetate up-regulates human (I)SHP-1 transcript expression in SKOV3 cells (an ovarian cancer cell line). Indirect evidence suggests that nuclear factor-kappaB might play a role in this induction. We also show that a 12-bp repeat in the distal SHP-1 promoter, which directs (I)SHP-1 expression, is of functional relevance as deletion of one copy of this E-box-containing 12-bp repeat resulted in a significant decrease in promoter activity. Electrophoretic mobility shift assays and supershift experiments showed that the upstream stimulatory factors USF1 and USF2 hetero-dimerize and interact with this 12 bp repeat. Our results suggest that USFs which have antiproliferative functions might regulate the expression of SHP-1, which itself is predominantly a negative growth regulator.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».