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Enregistrement W1507657967 · doi:10.1111/j.1742-4658.2006.05556.x

IMP1 interacts with poly(A)‐binding protein (PABP) and the autoregulatory translational control element of PABP‐mRNA through the KH III‐IV domain

2006· article· en· W1507657967 sur OpenAlexaff
Gopal Patel, Jnanankur Bag

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMessenger RNAPoly(A)-binding proteinCell biologyChemistryTranslation (biology)Domain (mathematical analysis)BiologyGeneBiochemistryMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Repression of poly(A)-binding protein (PABP) mRNA translation involves the formation of a heterotrimeric ribonucleoprotein complex by the binding of PABP, insulin-like growth factor II mRNA binding protein-1 (IMP1) and the unr gene encoded polypeptide (UNR) to the adenine-rich autoregulatory sequence (ARS) located at the 5' untranslated region of the PABP-mRNA. In this report, we have further characterized the interaction between PABP and IMP1 with the ARS at the molecular level. The dissociation constants of PABP and IMP1 for binding to the ARS RNA were determined to be 2.3 nM and 5.9 nM, respectively. Both PABP and IMP1 interact with each other, regardless of the presence of the ARS, through the conserved C-terminal PABP-C and K-homology (KH) III-IV domains, respectively. Interaction of PABP with the ARS requires at least three out of its four RNA-binding domains, whereas KH III-IV domain of IMP1 is necessary and sufficient for binding to the ARS. In addition, the strongest binding site for both PABP and IMP1 on the ARS was determined to be within the 22 nucleotide-long CCCAAAAAAAUUUACAAAAAA sequence located at the 3' end of the ARS. Results of our analysis suggest that both protein x protein and protein x RNA interactions are involved in forming a stable ribonucleoprotein complex at the ARS of PABP mRNA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,189
Score d'incertitude au seuil0,245

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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