IMP1 interacts with poly(A)‐binding protein (PABP) and the autoregulatory translational control element of PABP‐mRNA through the KH III‐IV domain
Notice bibliographique
Résumé
Repression of poly(A)-binding protein (PABP) mRNA translation involves the formation of a heterotrimeric ribonucleoprotein complex by the binding of PABP, insulin-like growth factor II mRNA binding protein-1 (IMP1) and the unr gene encoded polypeptide (UNR) to the adenine-rich autoregulatory sequence (ARS) located at the 5' untranslated region of the PABP-mRNA. In this report, we have further characterized the interaction between PABP and IMP1 with the ARS at the molecular level. The dissociation constants of PABP and IMP1 for binding to the ARS RNA were determined to be 2.3 nM and 5.9 nM, respectively. Both PABP and IMP1 interact with each other, regardless of the presence of the ARS, through the conserved C-terminal PABP-C and K-homology (KH) III-IV domains, respectively. Interaction of PABP with the ARS requires at least three out of its four RNA-binding domains, whereas KH III-IV domain of IMP1 is necessary and sufficient for binding to the ARS. In addition, the strongest binding site for both PABP and IMP1 on the ARS was determined to be within the 22 nucleotide-long CCCAAAAAAAUUUACAAAAAA sequence located at the 3' end of the ARS. Results of our analysis suggest that both protein x protein and protein x RNA interactions are involved in forming a stable ribonucleoprotein complex at the ARS of PABP mRNA.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».