Genomic organization of the <i>IGF1</i>, <i>IGF2</i>, <i>MYF5</i>, <i>MYF6</i> and <i>GRF</i>/<i>PACAP</i> genes across Salmoninae genera
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Whole-genome duplication in the ancient ray-finned fish and subsequent tetraploidization in the ancestor to the salmonids have complicated genomic and candidate gene studies in these organisms as many genes with multiple copies are present throughout their genomes. In an attempt to identify genes with a potential influence on growth and development, we investigated the genomic positions of insulin-like growth factors 1 and 2 (IGF1, IGF2), myogenic factors 5 and 6 (MYF5, MYF6) and growth hormone-releasing factor/pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide (GRF/PACAP) in three salmonid species: rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), Atlantic salmon (Salmo salar) and Arctic charr (Salvelinus alpinus). Our results suggest a tight association between the IGF1, MYF5 and MYF6 genes in all three species. We further localized the duplicated copies of IGF1 to the homeologous linkage groups RT-7/15 in rainbow trout and AC-3/24 in Arctic charr, and the two copies of MYF6 to homeologous linkage groups AS-22/24 in Atlantic salmon. Localization of GRF/PACAP to RT-7, AS-31 and AC-27 and IGF2 to RT-27, AS-2 and AC-4 in rainbow trout, Atlantic salmon and Arctic charr respectively is consistent with previously reported homologies among these chromosomal segments identified using other genetic markers. However, localization of the second copy of GRF/PACAP to RT-19 and AC-14 and the duplicated copy of IGF2 to AC-19 suggest a possible new homology/homeology between these chromosomes. These results might also be an indication of a more ancient polyploidization event that occurred deep in the ray-finned fish lineage.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle