Involvement of gene–diet/drug interaction in DNA methylation and its contribution to complex diseases: from cancer to schizophrenia
Notice bibliographique
Résumé
Most biological processes, including diseases, involve genetic and non-genetic factors. Also, the realization of a genetic potential may depend on environmental factors by directly affecting the expression of gene(s). Exactly how different environmental factors affect gene expression is not well understood. One of the mechanisms may involve DNA methylation and thereby gene expression. Diet, chemicals, and metals are known to affect DNA methylation and other epigenetic processes but are just beginning to be elucidated. For example, methylation of cytosine(s) in the promoter region could prevent the binding of transcription factors or create binding sites for complexes that deacetylate neighboring histones that in turn compact the chromatin, encouraging a gene to become silent. This article will discuss DNA methylation as an epigenetic mechanism of gene regulation and examine how factors like diet, chemicals, and metals may affect DNA methylation. The effect of alterations in DNA methylation may include aberrant expression of genes or genomes and chromosomal instability, which in turn may contribute to the etiology of complex multifactorial diseases. A similar mechanism is now recognized in a number of cancers. There is also indirect evidence to suggest that methylation could apply to a number of complex diseases, including schizophrenia.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».