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Enregistrement W1509865367 · doi:10.4049/jimmunol.1002008

Lunatic Fringe Enhances Competition for Delta-Like Notch Ligands but Does Not Overcome Defective Pre-TCR Signaling during Thymocyte β-Selection In Vivo

2010· article· en· W1509865367 sur OpenAlexafffund
Ioana Visan, Julie S. Yuan, Ying Liu, Pamela Stanley, Cynthia J. Guidos

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteU.S. Public Health ServiceCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick Children
Mots-clésThymocyteCell biologyT-cell receptorIn vivoNotch signaling pathwayBiologySignal transductionImmunologyT cellGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Notch1 activation by Delta-like (DL) Notch ligands is essential to induce T cell commitment and to suppress B cell development from thymus-seeding progenitors. Thymus-seeding progenitor competition for DL4 is critically regulated by Lunatic Fringe (Lfng), which glycosylates epidermal growth factor repeats in the Notch1 extracellular domain to enhance binding avidity for DL ligands. Notch1 activation is also essential for the process of β-selection, which drives TCRβ(+) CD4/CD8 double-negative 3 (DN3) precursors to proliferate and generate a large pool of CD4/CD8 double-positive thymocytes. We have used several genetic approaches to determine the importance of Lfng-Notch1 interactions in regulating competition of preselection and postselection DN3 thymocytes for DL ligands in vivo. Surprisingly, although Lfng overexpression enhanced DL4 binding by preselection DN3a thymocytes, it did not confer them with a competitive advantage in mixed chimeras. In contrast, Lfng overexpression enhanced competition of post-β-selection DN3b precursors for DL ligands. Lfng modification of O-fucose in the Notch1 ligand-binding domain contributed to but was not solely responsible for the developmental effects of Lfng overexpression. Although previous studies have suggested that pre-TCR-deficient DN3 thymocytes compete poorly for DL ligands, Lfng overexpression did not fully restore double-positive thymocyte pools from DN3b cells with pre-TCR signaling defects. Thus, pre-TCR and Notch signaling have largely nonoverlapping functions in β-selection. Collectively, our data reveal that Lfng enhances DN3b precursor competition for intrathymic DL ligands to maximize Notch-induced clonal expansion during the earliest stage of β-selection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,328

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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