Structural heterogeneity of carbohydrate modifications affects serospecificity of <i>Campylobacter</i> flagellins
Notice bibliographique
Résumé
Flagellin from Campylobacter coli VC167 is post-translationally modified at > or = 16 amino acid residues with pseudaminic acid and three related derivatives. The predominant modification was 5,7-diacetamido-3,5,7,9 - tetradeoxy - l - glycero - l - manno - nonulosonic acid (pseudaminic acid, Pse5Ac7Ac), a modification that has been described previously on flagellin from Campylobacter jejuni 81-176. VC167 lacked two modi-fications present in 81-176 and instead had two unique modifications of masses 431 and 432 Da. Flagellins from both C. jejuni 81-176 and C. coli VC167 were also modified with an acetamidino form of pseudaminic acid (PseAm), but tandem mass spectrometry indicated that the structure of PseAm differed in the two strains. Synthesis of PseAm in C. coli VC167 requires a minimum of six ptm genes. In contrast, PseAm is synthesized in C. jejuni 81-176 via an alternative pathway using the product of the pseA gene. Mutation of the ptm genes in C. coli VC167 can be detected by changes in apparent Mr of flagellin in SDS-PAGE gels, changes in isoelectric focusing (IEF) patterns and loss of immunoreactivity with antiserum LAH2. These changes corresponded to loss of both 315 Da and 431 Da modifications from flagellin. Complementation of the VC167 ptm mutants with the 81-176 pseA gene in trans resulted in flagellins containing both 315 and 431 Da modifications, but these flagellins remained unreactive in LAH2 antibody, suggesting that the unique form of PseAm encoded by the ptm genes contributes to the serospecificity of the flagellar filament.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».