MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1511421526 · doi:10.25011/cim.v31i4.4814

INVESTIGATING THE MOLECULAR AND DEVELOPMENTAL EFFECTS OF VARIOUS CULTURE REGIMES IN A MOUSE MODEL SYSTEM

2008· article· en· W1511421526 sur OpenAlexvenueno aff
Brenna A Market, Liyue Zhang, Lauren S. Magri, Michael C. Golding, Mellissa R.W. Mann

Notice bibliographique

RevueClinical and investigative medicine · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Syndromes and Imprinting
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenomic imprintingImprinting (psychology)EpigeneticsDNA methylationBiologyEmbryonic stem cellGeneticsMethylationBlastocystEmbryoEmbryogenesisGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background/Purpose: Genomic imprinting is a specialized transcriptional mechanism that results in the unequal expression of alleles based on their parent-of-origin [1]. Many imprinted genes are critical for proper embryonic and fetaldevelopment [2] and disruption of genomic imprinting are associated with many development disorders [3]. Recently, increased frequencies of imprinting disorders have been correlated with the use of assisted reproductive technologies (ARTs)[2]. Rigorous and thorough testing of ARTs is required to determine their influence on genomic imprinting and development. I hypothesize that imprinting maintenance mechanisms are disrupted during early mouse development by the environmental insult of culture media used in human ARTs, and that loss of imprinting correlates with delayed embryonic development. Methods: The specific aims of my project are to develop a method to evaluate the methylation and expression patterns of 4 known imprinted genes in individual blastocysts. Results: We have successfully developed a novel method to evaluate both imprinted methylation and expression from a single mouse blastocyst. This method has been tested and results compared to methods used to evaluate imprinted methylation and expression separately; we have determined that results obtained with a combined protocol are equivalent to either alone. I will use this method to evaluate relationships between development rates in culture andgenomic imprinting, as well as the effects of various culture media used formouse and human embryo culture on genomic imprinting. Conclusion: This analysis allow for a more comprehensive study ofthe effects of environmental insult on genomic imprinting and preimplantation embryo development. References: 1. Reik W, Walter J. Genomic imprinting:parental influence on the genome. Nat Rev Genet 2001;2:21-32. 2. Rodenhiser D, Mann M. Epigenetics andhuman disease: translating basic biology into clinical applications. CMAJ. 2006;174:341-8. 3.Paoloni-Giacobino A. Epigenetics in reproductive medicine. Pediatr Res 2007;61:51R-57R.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueClinical and investigative medicineMême sujetGenetic Syndromes and ImprintingTravaux en français237 207