Core structures of polysialylated glycans present in neural cell adhesion molecule from newborn mouse brain
Notice bibliographique
Résumé
Polysialylation of the neural cell adhesion molecule (N-CAM) is known to destabilize cell-cell adhesion and to promote plasticity in cell-cell interactions. To gain more insights into the molecular mechanisms regulating the selective expression of polysialic acid on distinct glycan chains, the underlying core structures of polysialylated N-CAM glycans from newborn mouse brain were examined. Starting from low picomolar amounts of oligosaccharides, a multistep approach was used that was based on various mass spectrometric techniques with minimized sample consumption. Evidence could be provided that polysialylated murine N-CAM glycans comprise diantennary, triantennary and tetraantennary core structures carrying, in part, type-1 N-acetyllactosamine antennae, sulfate groups linked to terminal galactose or subterminal N-acetylglucosamine residues and, as a characteristic feature, a sulfated glucuronic acid unit which was bound exclusively to C3 of terminal galactose in Manalpha3-linked type-2 antennae. Hence, our results reveal that part of the murine N-CAM carbohydrates are modified within a single oligosaccharide by polysialic acid plus a HSO3-GlcA-moiety, which is likely to represent a HNK1-epitope. As HNK1-carbohydrates are also known to modulate cell-cell interactions, the simultaneous presence of both carbohydrate epitopes may reflect a new mechanism involved in the fine-tuning of N-CAM functions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».