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Enregistrement W1511635820 · doi:10.1074/jbc.m202960200

A B-myb Promoter Corepressor Site Facilitatesin Vivo Occupation of the Adjacent E2F Site by p107·E2F and p130·E2F Complexes

2002· article· en· W1511635820 sur OpenAlexfundno aff
Steven Catchpole, Fiona Tavner, Laurent Le Cam, Claude Sardet, Roger J. Watson

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissement
Mots-clésE2FCorepressorMolecular biologyBiologyPromoterChromatin immunoprecipitationPsychological repressionRepressorBinding siteTranscription factorGeneGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transcription from the B-myb (MybL2 gene) promoter is strictly cell cycle-regulated by repression mediated through an E2F site during G(0)/early G(1). We report here the characterization of a corepressor site (downstream repression site (DRS)) required for this activity that is closely linked to the E2F site. Systematic mutagenesis of the DRS enabled a consensus to be derived, and it is notable that this sequence is compatible with cell cycle gene homology region sequences associated with cell cycle-dependent elements in the cyclin A, cdc2, and CDC25C promoters. The B-myb promoter is inappropriately active during G(0) in mouse embryo fibroblasts lacking the p107 and p130 pocket proteins, and we show that the ability of transfected p107 and p130 to re-impose repression on the promoter is dependent on the DRS. In contrast, transfected Rb was unable to repress the B-myb promoter. Consistent with the notion that Rb.E2F complexes are unable to bind the B-myb promoter E2F site in vivo, footprinting showed that this site is unoccupied in cells lacking p107 and p130. Chromatin immunoprecipitation assays showed a requirement for the DRS in recruiting p107 and p130 complexes to the B-myb promoter, indicating that in vivo the DRS governs the occupancy of the adjacent E2F site by transcriptional repressors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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