MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W151218290

Mutation and virulence assessment of chromosomal genes of Rhodococcus equi 103.

2007· article· en· W151218290 sur OpenAlexaff
Yanlong Pei, Valeria R. Parreira, Vivian M. Nicholson, John F. Prescott

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfectious Disease Case Reports and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutantVirulenceGeneBiologyMutationHomologous recombinationPlasmidComplementationGeneticsMicrobiology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rhodococcus equi can cause severe or fatal pneumonia in foals as well as in immunocompromised animals and humans. Its ability to persist in macrophages is fundamental to how it causes disease, but the basis of this is poorly understood. To examine further the general application of a recently developed system of targeted gene mutation and to assess the importance of different genes in resistance to innate immune defenses, we disrupted the genes encoding high-temperature requirement A (htrA), nitrate reductase (narG), peptidase D (pepD), phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase (purC), and superoxide dismutase (sodC) in strain 103 of R. equi using a double-crossover homologous recombination approach. Virulence testing by clearance after intravenous injection in mice showed that the htrA and narG mutants were fully attenuated, the purC and sodC mutants were unchanged, and the pepD mutant was slightly attenuated. Complementation with the pREM shuttle plasmid restored the virulence of the htrA and pepD mutants but not that of the narG mutant. A single-crossover mutation approach was simpler and faster than the double-crossover homologous recombination technique and was used to obtain mutations in 6 other genes potentially involved in virulence (clpB, fadD8, fbpB, glnA1, regX3, and sigF). These mutants were not attenuated in the mouse clearance assay. We were not able to obtain mutants for genesfurA, galE, and sigE using the single-crossover mutation approach. In summary, the targeted-mutation system had general applicability but was not always completely successful, perhaps because some genes are essential under the growth conditions used or because the success of mutation depends on the target genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,262
Score d'incertitude au seuil0,219

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePubMedMême sujetInfectious Disease Case Reports and TreatmentsTravaux en français237 207