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Enregistrement W1512932409 · doi:10.1002/em.21787

The increased expression of proteins involved in proliferation, DNA repair and DNA methylation in spleen of mice exposed to E. coli O157:H7 lipopolysaccharide

2013· article· en· W1512932409 sur OpenAlexaff
Igor Kovalchuk, Paul Walz, James Thomas, Olga Kovalchuk

Notice bibliographique

RevueEnvironmental and Molecular Mutagenesis · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversity of Lethbridge
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySpleenDNA methylationBacteriaDNA damageDNAProliferating cell nuclear antigenMolecular biologyKu70LipopolysaccharideDNA repairMethylationEscherichia coliMicrobiologyGene expressionBiochemistryGeneImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous research showed that the consumption of heat-killed E. coli O157:H7 bacteria resulted in an increase in the level of DNA damage in intestine, liver and spleen cells. We hypothesized that certain bacterial components released from heat-killed bacteria trigger this response. We analysed the possibility that bacterial components [such as lipopolysaccharides (LPS)] could induce changes in the level of proteins involved in cell proliferation, DNA repair and DNA methylation in distal spleen tissues of mice. Four-week-old male mice were provided water supplemented with whole heat-killed E. coli O157:H7 bacteria or components of bacteria (DNA, RNA, proteins and LPS). Spleen cells responded to exposure to whole heat-killed bacteria and LPS with an alteration in the level of PCNA proteins, DNA methylation proteins (DNMT1, DNMT3A, DNMT3B, and MeCP2) and DNA repair proteins (APE1 and KU70). Other bacterial components analysed in this study mostly did not alter protein expression. The data suggest that LPS is a bacterial component capable of inducing molecular changes in naïve spleen cells of hosts exposed to it.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,111
Score d'incertitude au seuil0,422

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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