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Enregistrement W1513478713 · doi:10.1158/1538-7445.am2014-2521

Abstract 2521: Small molecule inhibitors targeting the activation function-2 site of estrogen receptor-α

2014· article· en· W1513478713 sur OpenAlexaff
Kriti Singh, Ravi S. N. Munuganti, Eric Leblanc, Artem Cherkasov, Paul S. Rennie

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEstrogen and related hormone effects
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransactivationTamoxifenEstrogen receptorEstrogen receptor alphaReporter geneCancer researchEstrogenTransfectionBreast cancerSmall moleculeCoactivatorBiologyChemistryMedicineComputational biologyCancerInternal medicineTranscription factorGeneBiochemistryGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Approximately 75% of Breast Cancers (BCas) are classified as Estrogen Receptor alpha (ERα) positive. Treatment with anti-estrogens such as Tamoxifen has been the main therapeutic approach for more than 30 years. However, one third of women treated with Tamoxifen for 5 years develop recurrent disease. Experimental and clinical observations have suggested that ERα signalling continues to play an important role even after the development of resistance. Moreover, biopsies from BCa patients who relapsed on Tamoxifen indicated that ERα expression was retained in more than 50% of the cases. Because of the emergence of hormone resistance, there is a clear need to develop entirely novel anti-ERα therapeutics, such as drugs that would directly disrupt the interaction between ERα and its coactivator proteins at the corresponding regulatory interfaces, exemplified by a well-characterized Activation Function-2 (AF-2) site.In the current study we have used state of artificial intelligence systems to rationally select new anti-ERα drug candidates. Using the power of modern computers, we performed large-scale docking using millions of existing chemicals from the ZINC database and identified several promising small molecules as candidate AF-2 binders. We then conducted biological screens to identify compounds that can bind to the AF-2 pocket and inhibit ERα transactivation. A reporter assay was developed using T47D-Kbluc breast cancer cells, a line which had been stably transfected with an estrogen responsive luciferase reporter gene construct consisting of three estrogen response elements (EREs) upstream of a TATA promoter, to evaluate the potential of these compounds to inhibit ERα transcriptional activity. Compounds that inhibited ERα-mediated transcription of the reporter gene in a concentration dependent manner were further analysed. These compounds do not displace estrogen, but block ERα-coactivator interaction, as measured by TR-FRET assay, thereby confirming that inhibition of coactivator recruitment is not by the allosteric mechanism of conventional antagonists. One of our best compounds, VPC-16046, shows direct reversible binding to the ERα ligand binding domain as detected by Biolayer Interferometry assay. This compound demonstrated a strong anti-proliferative effect on MCF7, T47D and Tamoxifen resistant cells without affecting the growth of ERα-negative HeLa cells, used as a control in MTS assay.In summary, our study has identified a novel class of ERα AF2 inhibitors that have the potential to effectively inhibit ERα transcriptional activity by a mechanism which does not target the estrogen binding site and thereby circumvents treatment resistance seen with conventional, clinically used anti-estrogens. Treatment with these inhibitors should lead to a substantial improvement in the survival rate of women with advanced Tamoxifen-resistant BCa. Citation Format: Kriti Singh, Ravi Shashi Nayana Munuganti, Eric Leblanc, Artem Cherkasov, Paul S. Rennie. Small molecule inhibitors targeting the activation function-2 site of estrogen receptor-α. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 2521. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-2521

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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