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Enregistrement W1513867128 · doi:10.1111/j.1752-4571.2010.00142.x

Broad and fine-scale genetic analysis of white-tailed deer populations: estimating the relative risk of chronic wasting disease spread

2010· article· en· W1513867128 sur OpenAlexafffundabout
Catherine I. Cullingham, Evelyn H. Merrill, M. J. Pybus, Trent K. Bollinger, Gregory Wilson, David W. Coltman

Notice bibliographique

RevueEvolutionary Applications · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanAlberta Environment and Protected AreasUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta Conservation AssociationAlberta Prion Research InstitutePurdue University
Mots-clésOdocoileusChronic wasting diseaseBiologyBiological dispersalPhilopatryDiseaseTransmission (telecommunications)Wildlife diseasePopulationZoologyDemographyEcologyVeterinary medicineWildlifeScrapie

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic wasting disease is a transmissible spongiform encephalopathy of cervids, similar to sheep scrapie that has only recently been detected in wild populations of white-tailed deer (Odocoileus virginianus) and mule deer (Odocoileus hemionus hemionus) in western Canada. Relatively little is known about local transmission dynamics of the disease or the potential for long-distance spread. We analysed the population genetic structure of over 2000 white-tailed deer sampled from Alberta, British Columbia, and Saskatchewan using microsatellite profiles and mtDNA sequencing to assess the relative risk of disease spread. There was very little differentiation among subpopulations and a weak trend of increasing differentiation with geographic distance. This suggests that the potential for long-distance disease spread through the dispersal of infected individuals is possible, yet the risk of spread should gradually diminish with distance from infection foci. Within subpopulations, females were more related than expected by chance (R > 0) within a radius of approximately 500 m. Sex-biased philopatry and social interactions among related females may facilitate local disease transmission within social groups. Local herd reduction may therefore be an effective tool for reducing the disease prevalence when implemented at the appropriate spatial scale.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,064
Score d'incertitude au seuil0,128

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2010
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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