MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1513935208 · doi:10.3389/fnins.2015.00257

Boosting brain connectome classification accuracy in Alzheimer's disease using higher-order singular value decomposition

2015· article· en· W1513935208 sur OpenAlexfundno aff
Liang Zhan, Yashu Liu, Yalin Wang, Jiayu Zhou, Neda Jahanshad, Jieping Ye, Paul M. Thompson

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Neuroscience · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Mental HealthNational Institute on AgingNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthGenentechU.S. National Library of MedicineIXICOServierEisaiNorthern California Institute for Research and EducationUniversity of California, San DiegoPfizerBiogenBioClinicaAlzheimer's AssociationAmorfix Life SciencesNational Center for Research ResourcesF. Hoffmann-La RocheSynarcUniversity of Southern CaliforniaMedpaceAstraZenecaEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbNovartis Pharmaceuticals CorporationBayer HealthCareMeso Scale DiagnosticsNational Science Foundation
Mots-clésNeuroimagingConnectomeDiseaseProdromal StageAlzheimer's diseaseHuman Connectome ProjectArtificial intelligenceSingular value decompositionComputer scienceAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeLogistic regressionNeuroscienceDiffusion MRICognitive declinePattern recognition (psychology)CognitionMedicineMachine learningPsychologyCognitive impairmentMagnetic resonance imagingPathologyDementiaFunctional connectivityRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alzheimer's disease (AD) is a progressive brain disease. Accurate detection of AD and its prodromal stage, mild cognitive impairment (MCI), are crucial. There is also a growing interest in identifying brain imaging biomarkers that help to automatically differentiate stages of Alzheimer's disease. Here, we focused on brain structural networks computed from diffusion MRI and proposed a new feature extraction and classification framework based on higher order singular value decomposition and sparse logistic regression. In tests on publicly available data from the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative, our proposed framework showed promise in detecting brain network differences that help in classifying different stages of Alzheimer's disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,157
Tête enseignante GPT0,411
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in NeuroscienceMême sujetAdvanced Neuroimaging Techniques and ApplicationsTravaux en français237 207